Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z8

Ube2q2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q2, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2q2Q8K2Z8 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ube2q2Q8K2Z8 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ube2q2Q8K2Z8 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ube2q2Q8K2Z8 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ube2q2Q8K2Z8 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ube2q2Q8K2Z8 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ube2q2Q8K2Z8 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ube2q2Q8K2Z8 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ube2q2Q8K2Z8 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ube2q2Q8K2Z8 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ube2q2Q8K2Z8 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ube2q2Q8K2Z8 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ube2q2Q8K2Z8 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ube2q2Q8K2Z8 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ube2q2Q8K2Z8 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ube2q2Q8K2Z8 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ube2q2Q8K2Z8 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ube2q2Q8K2Z8 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ube2q2Q8K2Z8 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ube2q2Q8K2Z8 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ube2q2Q8K2Z8 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ube2q2Q8K2Z8 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ube2q2Q8K2Z8 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ube2q2Q8K2Z8 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ube2q2Q8K2Z8 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ube2q2Q8K2Z8 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Ube2q2Q8K2Z8 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ube2q2Q8K2Z8 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ube2q2Q8K2Z8 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ube2q2Q8K2Z8 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ube2q2Q8K2Z8 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ube2q2Q8K2Z8 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ube2q2Q8K2Z8 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ube2q2Q8K2Z8 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ube2q2Q8K2Z8 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ube2q2Q8K2Z8 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ube2q2Q8K2Z8 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ube2q2Q8K2Z8 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ube2q2Q8K2Z8 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ube2q2Q8K2Z8 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ube2q2Q8K2Z8 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ube2q2Q8K2Z8 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ube2q2Q8K2Z8 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ube2q2Q8K2Z8 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ube2q2Q8K2Z8 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ube2q2Q8K2Z8 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ube2q2Q8K2Z8 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ube2q2Q8K2Z8 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ube2q2Q8K2Z8 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ube2q2Q8K2Z8 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ube2q2Q8K2Z8 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ube2q2Q8K2Z8 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ube2q2Q8K2Z8 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ube2q2Q8K2Z8 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ube2q2Q8K2Z8 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ube2q2Q8K2Z8 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ube2q2Q8K2Z8 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ube2q2Q8K2Z8 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ube2q2Q8K2Z8 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ube2q2Q8K2Z8 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ube2q2Q8K2Z8 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ube2q2Q8K2Z8 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ube2q2Q8K2Z8 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Ube2q2Q8K2Z8 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ube2q2Q8K2Z8 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ube2q2Q8K2Z8 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ube2q2Q8K2Z8 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ube2q2Q8K2Z8 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ube2q2Q8K2Z8 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ube2q2Q8K2Z8 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ube2q2Q8K2Z8 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ube2q2Q8K2Z8 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ube2q2Q8K2Z8 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ube2q2Q8K2Z8 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ube2q2Q8K2Z8 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ube2q2Q8K2Z8 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ube2q2Q8K2Z8 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ube2q2Q8K2Z8 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ube2q2Q8K2Z8 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ube2q2Q8K2Z8 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ube2q2Q8K2Z8 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Ube2q2Q8K2Z8 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ube2q2Q8K2Z8 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ube2q2Q8K2Z8 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ube2q2Q8K2Z8 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ube2q2Q8K2Z8 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ube2q2Q8K2Z8 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ube2q2Q8K2Z8 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ube2q2Q8K2Z8 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ube2q2Q8K2Z8 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ube2q2Q8K2Z8 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ube2q2Q8K2Z8 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ube2q2Q8K2Z8 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ube2q2Q8K2Z8 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ube2q2Q8K2Z8 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ube2q2Q8K2Z8 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ube2q2Q8K2Z8 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ube2q2Q8K2Z8 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ube2q2Q8K2Z8 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ube2q2Q8K2Z8 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms