Protein–RNA interactions for Protein: Q8K168

1700001C19Rik, RIKEN cDNA 1700001C19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700001C19RikQ8K168 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
1700001C19RikQ8K168 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
1700001C19RikQ8K168 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
1700001C19RikQ8K168 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
1700001C19RikQ8K168 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
1700001C19RikQ8K168 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
1700001C19RikQ8K168 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
1700001C19RikQ8K168 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
1700001C19RikQ8K168 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
1700001C19RikQ8K168 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
1700001C19RikQ8K168 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
1700001C19RikQ8K168 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
1700001C19RikQ8K168 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
1700001C19RikQ8K168 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
1700001C19RikQ8K168 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
1700001C19RikQ8K168 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
1700001C19RikQ8K168 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
1700001C19RikQ8K168 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
1700001C19RikQ8K168 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
1700001C19RikQ8K168 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
1700001C19RikQ8K168 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
1700001C19RikQ8K168 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
1700001C19RikQ8K168 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
1700001C19RikQ8K168 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
1700001C19RikQ8K168 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
1700001C19RikQ8K168 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
1700001C19RikQ8K168 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
1700001C19RikQ8K168 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
1700001C19RikQ8K168 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
1700001C19RikQ8K168 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
1700001C19RikQ8K168 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
1700001C19RikQ8K168 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
1700001C19RikQ8K168 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
1700001C19RikQ8K168 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
1700001C19RikQ8K168 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
1700001C19RikQ8K168 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
1700001C19RikQ8K168 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
1700001C19RikQ8K168 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
1700001C19RikQ8K168 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
1700001C19RikQ8K168 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
1700001C19RikQ8K168 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
1700001C19RikQ8K168 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
1700001C19RikQ8K168 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
1700001C19RikQ8K168 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
1700001C19RikQ8K168 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
1700001C19RikQ8K168 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
1700001C19RikQ8K168 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
1700001C19RikQ8K168 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
1700001C19RikQ8K168 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
1700001C19RikQ8K168 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
1700001C19RikQ8K168 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
1700001C19RikQ8K168 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
1700001C19RikQ8K168 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
1700001C19RikQ8K168 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
1700001C19RikQ8K168 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
1700001C19RikQ8K168 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
1700001C19RikQ8K168 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
1700001C19RikQ8K168 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
1700001C19RikQ8K168 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
1700001C19RikQ8K168 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
1700001C19RikQ8K168 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
1700001C19RikQ8K168 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
1700001C19RikQ8K168 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
1700001C19RikQ8K168 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
1700001C19RikQ8K168 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
1700001C19RikQ8K168 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
1700001C19RikQ8K168 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
1700001C19RikQ8K168 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
1700001C19RikQ8K168 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
1700001C19RikQ8K168 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
1700001C19RikQ8K168 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
1700001C19RikQ8K168 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
1700001C19RikQ8K168 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
1700001C19RikQ8K168 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
1700001C19RikQ8K168 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
1700001C19RikQ8K168 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
1700001C19RikQ8K168 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
1700001C19RikQ8K168 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
1700001C19RikQ8K168 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
1700001C19RikQ8K168 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
1700001C19RikQ8K168 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
1700001C19RikQ8K168 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
1700001C19RikQ8K168 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
1700001C19RikQ8K168 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
1700001C19RikQ8K168 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
1700001C19RikQ8K168 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
1700001C19RikQ8K168 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
1700001C19RikQ8K168 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
1700001C19RikQ8K168 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
1700001C19RikQ8K168 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
1700001C19RikQ8K168 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
1700001C19RikQ8K168 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
1700001C19RikQ8K168 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
1700001C19RikQ8K168 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
1700001C19RikQ8K168 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
1700001C19RikQ8K168 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
1700001C19RikQ8K168 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
1700001C19RikQ8K168 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
1700001C19RikQ8K168 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
1700001C19RikQ8K168 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms