Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHG7

Rapgef2, Rap guanine nucleotide exchange factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,496 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rapgef2Q8CHG7 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Rapgef2Q8CHG7 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
Rapgef2Q8CHG7 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Rapgef2Q8CHG7 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Rapgef2Q8CHG7 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Rapgef2Q8CHG7 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Rapgef2Q8CHG7 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Rapgef2Q8CHG7 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
Rapgef2Q8CHG7 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Rapgef2Q8CHG7 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Rapgef2Q8CHG7 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
Rapgef2Q8CHG7 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Rapgef2Q8CHG7 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Rapgef2Q8CHG7 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
Rapgef2Q8CHG7 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC33.84■■■■□ 3.01
Rapgef2Q8CHG7 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Rapgef2Q8CHG7 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Rapgef2Q8CHG7 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
Rapgef2Q8CHG7 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
Rapgef2Q8CHG7 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Rapgef2Q8CHG7 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Rapgef2Q8CHG7 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Rapgef2Q8CHG7 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3.01
Rapgef2Q8CHG7 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
Rapgef2Q8CHG7 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
Rapgef2Q8CHG7 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Rapgef2Q8CHG7 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
Rapgef2Q8CHG7 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
Rapgef2Q8CHG7 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Rapgef2Q8CHG7 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Rapgef2Q8CHG7 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Rapgef2Q8CHG7 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Rapgef2Q8CHG7 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC33.82■■■■□ 3
Rapgef2Q8CHG7 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC33.82■■■■□ 3
Rapgef2Q8CHG7 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Rapgef2Q8CHG7 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Rapgef2Q8CHG7 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
Rapgef2Q8CHG7 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC33.8■■■■□ 3
Rapgef2Q8CHG7 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Rapgef2Q8CHG7 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Rapgef2Q8CHG7 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Rapgef2Q8CHG7 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC33.79■■■■□ 3
Rapgef2Q8CHG7 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Rapgef2Q8CHG7 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
Rapgef2Q8CHG7 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Rapgef2Q8CHG7 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
Rapgef2Q8CHG7 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Rapgef2Q8CHG7 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Rapgef2Q8CHG7 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
Rapgef2Q8CHG7 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Rapgef2Q8CHG7 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Rapgef2Q8CHG7 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
Rapgef2Q8CHG7 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
Rapgef2Q8CHG7 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC33.76■■■□□ 2.99
Rapgef2Q8CHG7 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Rapgef2Q8CHG7 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Rapgef2Q8CHG7 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
Rapgef2Q8CHG7 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Rapgef2Q8CHG7 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Rapgef2Q8CHG7 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Rapgef2Q8CHG7 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Rapgef2Q8CHG7 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Rapgef2Q8CHG7 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC33.73■■■□□ 2.99
Rapgef2Q8CHG7 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Rapgef2Q8CHG7 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Rapgef2Q8CHG7 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Rapgef2Q8CHG7 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Rapgef2Q8CHG7 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
Rapgef2Q8CHG7 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Rapgef2Q8CHG7 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Rapgef2Q8CHG7 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Rapgef2Q8CHG7 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Rapgef2Q8CHG7 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
Rapgef2Q8CHG7 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Rapgef2Q8CHG7 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Rapgef2Q8CHG7 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Rapgef2Q8CHG7 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Rapgef2Q8CHG7 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Rapgef2Q8CHG7 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Rapgef2Q8CHG7 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Rapgef2Q8CHG7 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Rapgef2Q8CHG7 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
Rapgef2Q8CHG7 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
Rapgef2Q8CHG7 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Rapgef2Q8CHG7 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
Rapgef2Q8CHG7 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC33.69■■■□□ 2.98
Rapgef2Q8CHG7 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
Rapgef2Q8CHG7 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Rapgef2Q8CHG7 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Rapgef2Q8CHG7 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
Rapgef2Q8CHG7 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC33.68■■■□□ 2.98
Rapgef2Q8CHG7 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Rapgef2Q8CHG7 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Rapgef2Q8CHG7 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Rapgef2Q8CHG7 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC33.66■■■□□ 2.98
Rapgef2Q8CHG7 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Rapgef2Q8CHG7 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Rapgef2Q8CHG7 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Rapgef2Q8CHG7 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
Rapgef2Q8CHG7 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms