Protein–RNA interactions for Protein: Q8CH25

Sltm, SAFB-like transcription modulator, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,031 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SltmQ8CH25 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SltmQ8CH25 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SltmQ8CH25 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SltmQ8CH25 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SltmQ8CH25 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SltmQ8CH25 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SltmQ8CH25 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SltmQ8CH25 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SltmQ8CH25 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SltmQ8CH25 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SltmQ8CH25 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SltmQ8CH25 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SltmQ8CH25 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SltmQ8CH25 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SltmQ8CH25 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SltmQ8CH25 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SltmQ8CH25 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SltmQ8CH25 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SltmQ8CH25 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SltmQ8CH25 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SltmQ8CH25 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SltmQ8CH25 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SltmQ8CH25 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SltmQ8CH25 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SltmQ8CH25 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
SltmQ8CH25 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SltmQ8CH25 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SltmQ8CH25 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SltmQ8CH25 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SltmQ8CH25 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SltmQ8CH25 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SltmQ8CH25 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SltmQ8CH25 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SltmQ8CH25 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SltmQ8CH25 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SltmQ8CH25 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SltmQ8CH25 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SltmQ8CH25 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SltmQ8CH25 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SltmQ8CH25 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SltmQ8CH25 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SltmQ8CH25 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SltmQ8CH25 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SltmQ8CH25 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SltmQ8CH25 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SltmQ8CH25 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SltmQ8CH25 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SltmQ8CH25 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SltmQ8CH25 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SltmQ8CH25 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SltmQ8CH25 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SltmQ8CH25 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SltmQ8CH25 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SltmQ8CH25 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SltmQ8CH25 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SltmQ8CH25 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SltmQ8CH25 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SltmQ8CH25 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SltmQ8CH25 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SltmQ8CH25 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SltmQ8CH25 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SltmQ8CH25 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SltmQ8CH25 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SltmQ8CH25 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SltmQ8CH25 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SltmQ8CH25 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SltmQ8CH25 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SltmQ8CH25 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SltmQ8CH25 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SltmQ8CH25 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SltmQ8CH25 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SltmQ8CH25 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SltmQ8CH25 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SltmQ8CH25 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SltmQ8CH25 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SltmQ8CH25 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SltmQ8CH25 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SltmQ8CH25 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SltmQ8CH25 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SltmQ8CH25 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SltmQ8CH25 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SltmQ8CH25 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SltmQ8CH25 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SltmQ8CH25 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SltmQ8CH25 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SltmQ8CH25 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SltmQ8CH25 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SltmQ8CH25 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SltmQ8CH25 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SltmQ8CH25 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SltmQ8CH25 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SltmQ8CH25 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SltmQ8CH25 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SltmQ8CH25 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SltmQ8CH25 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SltmQ8CH25 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SltmQ8CH25 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SltmQ8CH25 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SltmQ8CH25 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SltmQ8CH25 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 379.1 ms