Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGC6

Rbm28, RNA-binding protein 28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm28Q8CGC6 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rbm28Q8CGC6 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Rbm28Q8CGC6 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rbm28Q8CGC6 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rbm28Q8CGC6 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rbm28Q8CGC6 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rbm28Q8CGC6 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rbm28Q8CGC6 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rbm28Q8CGC6 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rbm28Q8CGC6 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Rbm28Q8CGC6 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rbm28Q8CGC6 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rbm28Q8CGC6 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rbm28Q8CGC6 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rbm28Q8CGC6 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rbm28Q8CGC6 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rbm28Q8CGC6 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rbm28Q8CGC6 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rbm28Q8CGC6 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rbm28Q8CGC6 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rbm28Q8CGC6 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Rbm28Q8CGC6 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Rbm28Q8CGC6 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rbm28Q8CGC6 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rbm28Q8CGC6 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rbm28Q8CGC6 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rbm28Q8CGC6 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rbm28Q8CGC6 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rbm28Q8CGC6 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rbm28Q8CGC6 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rbm28Q8CGC6 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rbm28Q8CGC6 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rbm28Q8CGC6 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rbm28Q8CGC6 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rbm28Q8CGC6 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rbm28Q8CGC6 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rbm28Q8CGC6 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rbm28Q8CGC6 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rbm28Q8CGC6 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rbm28Q8CGC6 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rbm28Q8CGC6 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rbm28Q8CGC6 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Rbm28Q8CGC6 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rbm28Q8CGC6 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rbm28Q8CGC6 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rbm28Q8CGC6 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rbm28Q8CGC6 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Rbm28Q8CGC6 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rbm28Q8CGC6 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rbm28Q8CGC6 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rbm28Q8CGC6 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rbm28Q8CGC6 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rbm28Q8CGC6 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rbm28Q8CGC6 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rbm28Q8CGC6 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rbm28Q8CGC6 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rbm28Q8CGC6 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rbm28Q8CGC6 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rbm28Q8CGC6 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Rbm28Q8CGC6 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rbm28Q8CGC6 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rbm28Q8CGC6 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rbm28Q8CGC6 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rbm28Q8CGC6 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rbm28Q8CGC6 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rbm28Q8CGC6 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rbm28Q8CGC6 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rbm28Q8CGC6 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rbm28Q8CGC6 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rbm28Q8CGC6 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rbm28Q8CGC6 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rbm28Q8CGC6 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rbm28Q8CGC6 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Rbm28Q8CGC6 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rbm28Q8CGC6 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rbm28Q8CGC6 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rbm28Q8CGC6 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rbm28Q8CGC6 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rbm28Q8CGC6 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rbm28Q8CGC6 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rbm28Q8CGC6 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rbm28Q8CGC6 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rbm28Q8CGC6 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rbm28Q8CGC6 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rbm28Q8CGC6 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rbm28Q8CGC6 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Rbm28Q8CGC6 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rbm28Q8CGC6 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rbm28Q8CGC6 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rbm28Q8CGC6 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rbm28Q8CGC6 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rbm28Q8CGC6 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rbm28Q8CGC6 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rbm28Q8CGC6 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rbm28Q8CGC6 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rbm28Q8CGC6 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rbm28Q8CGC6 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rbm28Q8CGC6 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rbm28Q8CGC6 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rbm28Q8CGC6 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
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