Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp27Q8CEG8 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp27Q8CEG8 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp27Q8CEG8 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp27Q8CEG8 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp27Q8CEG8 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp27Q8CEG8 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp27Q8CEG8 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp27Q8CEG8 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp27Q8CEG8 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp27Q8CEG8 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp27Q8CEG8 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp27Q8CEG8 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp27Q8CEG8 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp27Q8CEG8 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp27Q8CEG8 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp27Q8CEG8 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp27Q8CEG8 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp27Q8CEG8 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp27Q8CEG8 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp27Q8CEG8 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp27Q8CEG8 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp27Q8CEG8 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp27Q8CEG8 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp27Q8CEG8 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp27Q8CEG8 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp27Q8CEG8 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp27Q8CEG8 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp27Q8CEG8 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp27Q8CEG8 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp27Q8CEG8 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp27Q8CEG8 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp27Q8CEG8 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp27Q8CEG8 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp27Q8CEG8 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp27Q8CEG8 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp27Q8CEG8 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp27Q8CEG8 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp27Q8CEG8 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp27Q8CEG8 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp27Q8CEG8 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp27Q8CEG8 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp27Q8CEG8 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp27Q8CEG8 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp27Q8CEG8 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp27Q8CEG8 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp27Q8CEG8 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp27Q8CEG8 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp27Q8CEG8 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp27Q8CEG8 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp27Q8CEG8 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp27Q8CEG8 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp27Q8CEG8 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp27Q8CEG8 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp27Q8CEG8 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp27Q8CEG8 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp27Q8CEG8 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp27Q8CEG8 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp27Q8CEG8 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp27Q8CEG8 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp27Q8CEG8 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp27Q8CEG8 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp27Q8CEG8 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp27Q8CEG8 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp27Q8CEG8 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp27Q8CEG8 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp27Q8CEG8 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp27Q8CEG8 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp27Q8CEG8 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp27Q8CEG8 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp27Q8CEG8 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp27Q8CEG8 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp27Q8CEG8 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp27Q8CEG8 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp27Q8CEG8 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp27Q8CEG8 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp27Q8CEG8 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp27Q8CEG8 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp27Q8CEG8 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp27Q8CEG8 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp27Q8CEG8 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp27Q8CEG8 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp27Q8CEG8 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Usp27Q8CEG8 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Usp27Q8CEG8 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Usp27Q8CEG8 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Usp27Q8CEG8 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Usp27Q8CEG8 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Usp27Q8CEG8 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp27Q8CEG8 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp27Q8CEG8 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp27Q8CEG8 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp27Q8CEG8 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp27Q8CEG8 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp27Q8CEG8 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp27Q8CEG8 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp27Q8CEG8 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp27Q8CEG8 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp27Q8CEG8 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp27Q8CEG8 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
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