Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG5

Ccdc28b, Coiled-coil domain-containing protein 28B, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc28bQ8CEG5 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc28bQ8CEG5 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc28bQ8CEG5 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc28bQ8CEG5 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc28bQ8CEG5 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc28bQ8CEG5 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc28bQ8CEG5 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc28bQ8CEG5 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc28bQ8CEG5 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc28bQ8CEG5 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc28bQ8CEG5 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc28bQ8CEG5 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc28bQ8CEG5 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc28bQ8CEG5 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc28bQ8CEG5 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc28bQ8CEG5 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc28bQ8CEG5 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc28bQ8CEG5 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc28bQ8CEG5 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc28bQ8CEG5 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc28bQ8CEG5 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc28bQ8CEG5 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc28bQ8CEG5 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc28bQ8CEG5 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc28bQ8CEG5 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc28bQ8CEG5 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc28bQ8CEG5 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc28bQ8CEG5 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc28bQ8CEG5 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc28bQ8CEG5 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc28bQ8CEG5 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc28bQ8CEG5 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc28bQ8CEG5 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc28bQ8CEG5 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc28bQ8CEG5 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc28bQ8CEG5 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc28bQ8CEG5 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc28bQ8CEG5 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc28bQ8CEG5 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc28bQ8CEG5 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc28bQ8CEG5 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc28bQ8CEG5 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc28bQ8CEG5 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc28bQ8CEG5 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc28bQ8CEG5 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc28bQ8CEG5 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc28bQ8CEG5 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc28bQ8CEG5 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc28bQ8CEG5 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc28bQ8CEG5 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc28bQ8CEG5 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc28bQ8CEG5 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc28bQ8CEG5 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc28bQ8CEG5 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc28bQ8CEG5 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc28bQ8CEG5 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc28bQ8CEG5 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc28bQ8CEG5 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc28bQ8CEG5 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc28bQ8CEG5 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc28bQ8CEG5 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc28bQ8CEG5 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc28bQ8CEG5 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc28bQ8CEG5 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc28bQ8CEG5 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc28bQ8CEG5 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc28bQ8CEG5 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc28bQ8CEG5 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc28bQ8CEG5 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc28bQ8CEG5 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc28bQ8CEG5 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc28bQ8CEG5 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc28bQ8CEG5 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc28bQ8CEG5 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc28bQ8CEG5 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc28bQ8CEG5 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc28bQ8CEG5 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc28bQ8CEG5 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ccdc28bQ8CEG5 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc28bQ8CEG5 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc28bQ8CEG5 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc28bQ8CEG5 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc28bQ8CEG5 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc28bQ8CEG5 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc28bQ8CEG5 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc28bQ8CEG5 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc28bQ8CEG5 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc28bQ8CEG5 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc28bQ8CEG5 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc28bQ8CEG5 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc28bQ8CEG5 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc28bQ8CEG5 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc28bQ8CEG5 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc28bQ8CEG5 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc28bQ8CEG5 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc28bQ8CEG5 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc28bQ8CEG5 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc28bQ8CEG5 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc28bQ8CEG5 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc28bQ8CEG5 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms