Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5L3

Cnot2, CCR4-NOT transcription complex subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot2Q8C5L3 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cnot2Q8C5L3 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cnot2Q8C5L3 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cnot2Q8C5L3 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Cnot2Q8C5L3 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cnot2Q8C5L3 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cnot2Q8C5L3 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cnot2Q8C5L3 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cnot2Q8C5L3 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cnot2Q8C5L3 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cnot2Q8C5L3 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Cnot2Q8C5L3 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cnot2Q8C5L3 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cnot2Q8C5L3 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cnot2Q8C5L3 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cnot2Q8C5L3 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cnot2Q8C5L3 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cnot2Q8C5L3 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cnot2Q8C5L3 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cnot2Q8C5L3 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cnot2Q8C5L3 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cnot2Q8C5L3 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cnot2Q8C5L3 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cnot2Q8C5L3 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cnot2Q8C5L3 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Cnot2Q8C5L3 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cnot2Q8C5L3 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cnot2Q8C5L3 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cnot2Q8C5L3 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cnot2Q8C5L3 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cnot2Q8C5L3 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Cnot2Q8C5L3 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cnot2Q8C5L3 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cnot2Q8C5L3 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Cnot2Q8C5L3 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cnot2Q8C5L3 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cnot2Q8C5L3 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cnot2Q8C5L3 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cnot2Q8C5L3 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cnot2Q8C5L3 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cnot2Q8C5L3 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cnot2Q8C5L3 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cnot2Q8C5L3 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cnot2Q8C5L3 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cnot2Q8C5L3 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cnot2Q8C5L3 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cnot2Q8C5L3 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cnot2Q8C5L3 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cnot2Q8C5L3 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cnot2Q8C5L3 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Cnot2Q8C5L3 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cnot2Q8C5L3 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cnot2Q8C5L3 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cnot2Q8C5L3 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cnot2Q8C5L3 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cnot2Q8C5L3 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cnot2Q8C5L3 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cnot2Q8C5L3 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cnot2Q8C5L3 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cnot2Q8C5L3 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Cnot2Q8C5L3 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cnot2Q8C5L3 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cnot2Q8C5L3 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cnot2Q8C5L3 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Cnot2Q8C5L3 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cnot2Q8C5L3 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cnot2Q8C5L3 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cnot2Q8C5L3 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cnot2Q8C5L3 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cnot2Q8C5L3 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cnot2Q8C5L3 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cnot2Q8C5L3 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cnot2Q8C5L3 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cnot2Q8C5L3 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cnot2Q8C5L3 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cnot2Q8C5L3 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cnot2Q8C5L3 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cnot2Q8C5L3 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cnot2Q8C5L3 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cnot2Q8C5L3 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cnot2Q8C5L3 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cnot2Q8C5L3 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cnot2Q8C5L3 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cnot2Q8C5L3 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cnot2Q8C5L3 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cnot2Q8C5L3 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cnot2Q8C5L3 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cnot2Q8C5L3 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cnot2Q8C5L3 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Cnot2Q8C5L3 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cnot2Q8C5L3 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cnot2Q8C5L3 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cnot2Q8C5L3 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cnot2Q8C5L3 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cnot2Q8C5L3 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cnot2Q8C5L3 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cnot2Q8C5L3 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cnot2Q8C5L3 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cnot2Q8C5L3 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cnot2Q8C5L3 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
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