Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0Q4

Nek11, Serine/threonine-protein kinase Nek11, mousemouse

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Length 628 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek11Q8C0Q4 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nek11Q8C0Q4 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nek11Q8C0Q4 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Nek11Q8C0Q4 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nek11Q8C0Q4 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nek11Q8C0Q4 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nek11Q8C0Q4 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nek11Q8C0Q4 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nek11Q8C0Q4 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Nek11Q8C0Q4 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nek11Q8C0Q4 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nek11Q8C0Q4 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nek11Q8C0Q4 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nek11Q8C0Q4 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nek11Q8C0Q4 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Nek11Q8C0Q4 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nek11Q8C0Q4 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nek11Q8C0Q4 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nek11Q8C0Q4 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nek11Q8C0Q4 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nek11Q8C0Q4 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nek11Q8C0Q4 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Nek11Q8C0Q4 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nek11Q8C0Q4 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nek11Q8C0Q4 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Nek11Q8C0Q4 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nek11Q8C0Q4 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nek11Q8C0Q4 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nek11Q8C0Q4 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nek11Q8C0Q4 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nek11Q8C0Q4 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nek11Q8C0Q4 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nek11Q8C0Q4 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Nek11Q8C0Q4 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nek11Q8C0Q4 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nek11Q8C0Q4 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nek11Q8C0Q4 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nek11Q8C0Q4 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nek11Q8C0Q4 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nek11Q8C0Q4 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nek11Q8C0Q4 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nek11Q8C0Q4 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nek11Q8C0Q4 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nek11Q8C0Q4 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nek11Q8C0Q4 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nek11Q8C0Q4 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nek11Q8C0Q4 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Nek11Q8C0Q4 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nek11Q8C0Q4 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nek11Q8C0Q4 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nek11Q8C0Q4 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nek11Q8C0Q4 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nek11Q8C0Q4 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nek11Q8C0Q4 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nek11Q8C0Q4 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nek11Q8C0Q4 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nek11Q8C0Q4 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nek11Q8C0Q4 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nek11Q8C0Q4 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Nek11Q8C0Q4 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Nek11Q8C0Q4 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Nek11Q8C0Q4 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Nek11Q8C0Q4 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nek11Q8C0Q4 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nek11Q8C0Q4 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nek11Q8C0Q4 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nek11Q8C0Q4 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Nek11Q8C0Q4 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nek11Q8C0Q4 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nek11Q8C0Q4 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nek11Q8C0Q4 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nek11Q8C0Q4 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nek11Q8C0Q4 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nek11Q8C0Q4 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nek11Q8C0Q4 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nek11Q8C0Q4 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nek11Q8C0Q4 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nek11Q8C0Q4 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Nek11Q8C0Q4 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Nek11Q8C0Q4 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nek11Q8C0Q4 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nek11Q8C0Q4 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nek11Q8C0Q4 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Nek11Q8C0Q4 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Nek11Q8C0Q4 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nek11Q8C0Q4 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nek11Q8C0Q4 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nek11Q8C0Q4 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nek11Q8C0Q4 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nek11Q8C0Q4 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nek11Q8C0Q4 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nek11Q8C0Q4 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nek11Q8C0Q4 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nek11Q8C0Q4 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nek11Q8C0Q4 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nek11Q8C0Q4 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nek11Q8C0Q4 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nek11Q8C0Q4 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nek11Q8C0Q4 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Nek11Q8C0Q4 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
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