Protein–RNA interactions for Protein: Q8BU47

E330017A01Rik, Ferritin, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E330017A01RikQ8BU47 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
E330017A01RikQ8BU47 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
E330017A01RikQ8BU47 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
E330017A01RikQ8BU47 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
E330017A01RikQ8BU47 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
E330017A01RikQ8BU47 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
E330017A01RikQ8BU47 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
E330017A01RikQ8BU47 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
E330017A01RikQ8BU47 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
E330017A01RikQ8BU47 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
E330017A01RikQ8BU47 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
E330017A01RikQ8BU47 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
E330017A01RikQ8BU47 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
E330017A01RikQ8BU47 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
E330017A01RikQ8BU47 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
E330017A01RikQ8BU47 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
E330017A01RikQ8BU47 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
E330017A01RikQ8BU47 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
E330017A01RikQ8BU47 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
E330017A01RikQ8BU47 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
E330017A01RikQ8BU47 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
E330017A01RikQ8BU47 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
E330017A01RikQ8BU47 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
E330017A01RikQ8BU47 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
E330017A01RikQ8BU47 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
E330017A01RikQ8BU47 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
E330017A01RikQ8BU47 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
E330017A01RikQ8BU47 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
E330017A01RikQ8BU47 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
E330017A01RikQ8BU47 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
E330017A01RikQ8BU47 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
E330017A01RikQ8BU47 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
E330017A01RikQ8BU47 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
E330017A01RikQ8BU47 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
E330017A01RikQ8BU47 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
E330017A01RikQ8BU47 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
E330017A01RikQ8BU47 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
E330017A01RikQ8BU47 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
E330017A01RikQ8BU47 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
E330017A01RikQ8BU47 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
E330017A01RikQ8BU47 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
E330017A01RikQ8BU47 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
E330017A01RikQ8BU47 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
E330017A01RikQ8BU47 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
E330017A01RikQ8BU47 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
E330017A01RikQ8BU47 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
E330017A01RikQ8BU47 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
E330017A01RikQ8BU47 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
E330017A01RikQ8BU47 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
E330017A01RikQ8BU47 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
E330017A01RikQ8BU47 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
E330017A01RikQ8BU47 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
E330017A01RikQ8BU47 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
E330017A01RikQ8BU47 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
E330017A01RikQ8BU47 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
E330017A01RikQ8BU47 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
E330017A01RikQ8BU47 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
E330017A01RikQ8BU47 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
E330017A01RikQ8BU47 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
E330017A01RikQ8BU47 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
E330017A01RikQ8BU47 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
E330017A01RikQ8BU47 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
E330017A01RikQ8BU47 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
E330017A01RikQ8BU47 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
E330017A01RikQ8BU47 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
E330017A01RikQ8BU47 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
E330017A01RikQ8BU47 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
E330017A01RikQ8BU47 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
E330017A01RikQ8BU47 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
E330017A01RikQ8BU47 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
E330017A01RikQ8BU47 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
E330017A01RikQ8BU47 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
E330017A01RikQ8BU47 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
E330017A01RikQ8BU47 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
E330017A01RikQ8BU47 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
E330017A01RikQ8BU47 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
E330017A01RikQ8BU47 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
E330017A01RikQ8BU47 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
E330017A01RikQ8BU47 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
E330017A01RikQ8BU47 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
E330017A01RikQ8BU47 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
E330017A01RikQ8BU47 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
E330017A01RikQ8BU47 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
E330017A01RikQ8BU47 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
E330017A01RikQ8BU47 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
E330017A01RikQ8BU47 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
E330017A01RikQ8BU47 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
E330017A01RikQ8BU47 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
E330017A01RikQ8BU47 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
E330017A01RikQ8BU47 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
E330017A01RikQ8BU47 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
E330017A01RikQ8BU47 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
E330017A01RikQ8BU47 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
E330017A01RikQ8BU47 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
E330017A01RikQ8BU47 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
E330017A01RikQ8BU47 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
E330017A01RikQ8BU47 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
E330017A01RikQ8BU47 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
E330017A01RikQ8BU47 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
E330017A01RikQ8BU47 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms