Protein–RNA interactions for Protein: Q8BK35

Nop53, Ribosome biogenesis protein NOP53, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop53Q8BK35 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nop53Q8BK35 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nop53Q8BK35 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nop53Q8BK35 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nop53Q8BK35 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nop53Q8BK35 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nop53Q8BK35 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nop53Q8BK35 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nop53Q8BK35 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nop53Q8BK35 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Nop53Q8BK35 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nop53Q8BK35 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nop53Q8BK35 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nop53Q8BK35 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Nop53Q8BK35 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nop53Q8BK35 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nop53Q8BK35 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nop53Q8BK35 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nop53Q8BK35 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Nop53Q8BK35 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nop53Q8BK35 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nop53Q8BK35 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nop53Q8BK35 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nop53Q8BK35 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nop53Q8BK35 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nop53Q8BK35 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nop53Q8BK35 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nop53Q8BK35 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Nop53Q8BK35 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nop53Q8BK35 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nop53Q8BK35 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nop53Q8BK35 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nop53Q8BK35 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nop53Q8BK35 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nop53Q8BK35 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nop53Q8BK35 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nop53Q8BK35 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nop53Q8BK35 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nop53Q8BK35 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nop53Q8BK35 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nop53Q8BK35 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nop53Q8BK35 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nop53Q8BK35 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nop53Q8BK35 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nop53Q8BK35 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nop53Q8BK35 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Nop53Q8BK35 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nop53Q8BK35 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nop53Q8BK35 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nop53Q8BK35 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nop53Q8BK35 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nop53Q8BK35 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nop53Q8BK35 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nop53Q8BK35 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nop53Q8BK35 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nop53Q8BK35 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nop53Q8BK35 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nop53Q8BK35 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nop53Q8BK35 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nop53Q8BK35 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nop53Q8BK35 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nop53Q8BK35 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nop53Q8BK35 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nop53Q8BK35 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nop53Q8BK35 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nop53Q8BK35 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Nop53Q8BK35 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nop53Q8BK35 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nop53Q8BK35 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nop53Q8BK35 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nop53Q8BK35 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Nop53Q8BK35 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Nop53Q8BK35 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Nop53Q8BK35 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nop53Q8BK35 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nop53Q8BK35 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nop53Q8BK35 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nop53Q8BK35 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nop53Q8BK35 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nop53Q8BK35 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nop53Q8BK35 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nop53Q8BK35 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nop53Q8BK35 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nop53Q8BK35 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nop53Q8BK35 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nop53Q8BK35 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nop53Q8BK35 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nop53Q8BK35 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nop53Q8BK35 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nop53Q8BK35 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nop53Q8BK35 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nop53Q8BK35 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nop53Q8BK35 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nop53Q8BK35 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nop53Q8BK35 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nop53Q8BK35 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nop53Q8BK35 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nop53Q8BK35 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nop53Q8BK35 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nop53Q8BK35 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms