Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJ71

Nup93, Nuclear pore complex protein Nup93, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 819 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup93Q8BJ71 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nup93Q8BJ71 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nup93Q8BJ71 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Nup93Q8BJ71 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nup93Q8BJ71 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nup93Q8BJ71 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nup93Q8BJ71 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nup93Q8BJ71 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Nup93Q8BJ71 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Nup93Q8BJ71 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nup93Q8BJ71 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Nup93Q8BJ71 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nup93Q8BJ71 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Nup93Q8BJ71 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nup93Q8BJ71 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nup93Q8BJ71 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nup93Q8BJ71 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Nup93Q8BJ71 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Nup93Q8BJ71 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nup93Q8BJ71 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nup93Q8BJ71 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Nup93Q8BJ71 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Nup93Q8BJ71 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Nup93Q8BJ71 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nup93Q8BJ71 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nup93Q8BJ71 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nup93Q8BJ71 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nup93Q8BJ71 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Nup93Q8BJ71 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Nup93Q8BJ71 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nup93Q8BJ71 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Nup93Q8BJ71 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Nup93Q8BJ71 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nup93Q8BJ71 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Nup93Q8BJ71 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nup93Q8BJ71 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nup93Q8BJ71 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nup93Q8BJ71 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Nup93Q8BJ71 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Nup93Q8BJ71 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Nup93Q8BJ71 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nup93Q8BJ71 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nup93Q8BJ71 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nup93Q8BJ71 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nup93Q8BJ71 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nup93Q8BJ71 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nup93Q8BJ71 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Nup93Q8BJ71 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nup93Q8BJ71 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nup93Q8BJ71 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nup93Q8BJ71 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nup93Q8BJ71 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nup93Q8BJ71 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nup93Q8BJ71 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nup93Q8BJ71 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nup93Q8BJ71 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nup93Q8BJ71 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nup93Q8BJ71 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nup93Q8BJ71 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nup93Q8BJ71 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nup93Q8BJ71 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nup93Q8BJ71 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nup93Q8BJ71 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nup93Q8BJ71 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nup93Q8BJ71 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nup93Q8BJ71 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nup93Q8BJ71 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nup93Q8BJ71 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nup93Q8BJ71 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nup93Q8BJ71 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nup93Q8BJ71 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nup93Q8BJ71 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nup93Q8BJ71 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nup93Q8BJ71 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nup93Q8BJ71 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nup93Q8BJ71 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nup93Q8BJ71 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nup93Q8BJ71 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nup93Q8BJ71 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nup93Q8BJ71 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nup93Q8BJ71 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nup93Q8BJ71 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nup93Q8BJ71 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nup93Q8BJ71 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nup93Q8BJ71 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nup93Q8BJ71 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nup93Q8BJ71 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nup93Q8BJ71 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nup93Q8BJ71 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nup93Q8BJ71 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nup93Q8BJ71 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nup93Q8BJ71 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nup93Q8BJ71 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nup93Q8BJ71 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nup93Q8BJ71 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nup93Q8BJ71 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nup93Q8BJ71 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nup93Q8BJ71 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nup93Q8BJ71 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
Nup93Q8BJ71 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms