Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGU0

Cyp4f39, Cytochrome P450, family 4, subfamily f, polypeptide 39, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp4f39Q8BGU0 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cyp4f39Q8BGU0 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Cyp4f39Q8BGU0 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cyp4f39Q8BGU0 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cyp4f39Q8BGU0 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cyp4f39Q8BGU0 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cyp4f39Q8BGU0 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cyp4f39Q8BGU0 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cyp4f39Q8BGU0 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Cyp4f39Q8BGU0 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cyp4f39Q8BGU0 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cyp4f39Q8BGU0 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cyp4f39Q8BGU0 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cyp4f39Q8BGU0 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cyp4f39Q8BGU0 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Cyp4f39Q8BGU0 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cyp4f39Q8BGU0 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cyp4f39Q8BGU0 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cyp4f39Q8BGU0 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Cyp4f39Q8BGU0 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cyp4f39Q8BGU0 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cyp4f39Q8BGU0 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Cyp4f39Q8BGU0 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cyp4f39Q8BGU0 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cyp4f39Q8BGU0 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cyp4f39Q8BGU0 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cyp4f39Q8BGU0 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cyp4f39Q8BGU0 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cyp4f39Q8BGU0 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cyp4f39Q8BGU0 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Cyp4f39Q8BGU0 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cyp4f39Q8BGU0 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cyp4f39Q8BGU0 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cyp4f39Q8BGU0 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cyp4f39Q8BGU0 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Cyp4f39Q8BGU0 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cyp4f39Q8BGU0 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Cyp4f39Q8BGU0 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Cyp4f39Q8BGU0 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cyp4f39Q8BGU0 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cyp4f39Q8BGU0 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cyp4f39Q8BGU0 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cyp4f39Q8BGU0 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cyp4f39Q8BGU0 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cyp4f39Q8BGU0 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cyp4f39Q8BGU0 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cyp4f39Q8BGU0 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cyp4f39Q8BGU0 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cyp4f39Q8BGU0 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cyp4f39Q8BGU0 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cyp4f39Q8BGU0 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cyp4f39Q8BGU0 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cyp4f39Q8BGU0 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cyp4f39Q8BGU0 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cyp4f39Q8BGU0 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cyp4f39Q8BGU0 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cyp4f39Q8BGU0 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cyp4f39Q8BGU0 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cyp4f39Q8BGU0 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cyp4f39Q8BGU0 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cyp4f39Q8BGU0 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cyp4f39Q8BGU0 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cyp4f39Q8BGU0 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cyp4f39Q8BGU0 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cyp4f39Q8BGU0 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cyp4f39Q8BGU0 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cyp4f39Q8BGU0 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cyp4f39Q8BGU0 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cyp4f39Q8BGU0 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Cyp4f39Q8BGU0 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cyp4f39Q8BGU0 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cyp4f39Q8BGU0 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cyp4f39Q8BGU0 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cyp4f39Q8BGU0 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cyp4f39Q8BGU0 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cyp4f39Q8BGU0 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cyp4f39Q8BGU0 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cyp4f39Q8BGU0 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Cyp4f39Q8BGU0 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cyp4f39Q8BGU0 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cyp4f39Q8BGU0 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cyp4f39Q8BGU0 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cyp4f39Q8BGU0 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Cyp4f39Q8BGU0 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cyp4f39Q8BGU0 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cyp4f39Q8BGU0 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cyp4f39Q8BGU0 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cyp4f39Q8BGU0 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cyp4f39Q8BGU0 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cyp4f39Q8BGU0 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Cyp4f39Q8BGU0 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cyp4f39Q8BGU0 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cyp4f39Q8BGU0 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cyp4f39Q8BGU0 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cyp4f39Q8BGU0 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cyp4f39Q8BGU0 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cyp4f39Q8BGU0 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cyp4f39Q8BGU0 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Cyp4f39Q8BGU0 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cyp4f39Q8BGU0 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms