Protein–RNA interactions for Protein: Q810U5

Ccdc50, Coiled-coil domain-containing protein 50, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc50Q810U5 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc50Q810U5 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ccdc50Q810U5 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ccdc50Q810U5 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ccdc50Q810U5 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc50Q810U5 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc50Q810U5 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc50Q810U5 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc50Q810U5 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc50Q810U5 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc50Q810U5 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc50Q810U5 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc50Q810U5 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc50Q810U5 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc50Q810U5 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc50Q810U5 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc50Q810U5 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc50Q810U5 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc50Q810U5 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc50Q810U5 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc50Q810U5 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc50Q810U5 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc50Q810U5 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc50Q810U5 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc50Q810U5 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc50Q810U5 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc50Q810U5 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc50Q810U5 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc50Q810U5 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc50Q810U5 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc50Q810U5 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc50Q810U5 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc50Q810U5 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc50Q810U5 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc50Q810U5 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc50Q810U5 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc50Q810U5 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc50Q810U5 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc50Q810U5 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc50Q810U5 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc50Q810U5 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc50Q810U5 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc50Q810U5 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc50Q810U5 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc50Q810U5 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc50Q810U5 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc50Q810U5 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc50Q810U5 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc50Q810U5 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc50Q810U5 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc50Q810U5 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc50Q810U5 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc50Q810U5 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc50Q810U5 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc50Q810U5 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc50Q810U5 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc50Q810U5 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc50Q810U5 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc50Q810U5 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc50Q810U5 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc50Q810U5 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc50Q810U5 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc50Q810U5 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc50Q810U5 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc50Q810U5 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc50Q810U5 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc50Q810U5 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc50Q810U5 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc50Q810U5 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc50Q810U5 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc50Q810U5 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc50Q810U5 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc50Q810U5 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc50Q810U5 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc50Q810U5 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc50Q810U5 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc50Q810U5 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc50Q810U5 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc50Q810U5 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc50Q810U5 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc50Q810U5 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc50Q810U5 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc50Q810U5 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc50Q810U5 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc50Q810U5 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc50Q810U5 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc50Q810U5 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc50Q810U5 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc50Q810U5 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc50Q810U5 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc50Q810U5 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc50Q810U5 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc50Q810U5 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc50Q810U5 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc50Q810U5 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc50Q810U5 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc50Q810U5 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc50Q810U5 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc50Q810U5 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc50Q810U5 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms