Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSQ1

Clec18a, C-type lectin domain family 18 member A, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec18aQ7TSQ1 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Clec18aQ7TSQ1 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Clec18aQ7TSQ1 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Clec18aQ7TSQ1 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Clec18aQ7TSQ1 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Clec18aQ7TSQ1 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Clec18aQ7TSQ1 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Clec18aQ7TSQ1 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Clec18aQ7TSQ1 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Clec18aQ7TSQ1 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Clec18aQ7TSQ1 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Clec18aQ7TSQ1 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Clec18aQ7TSQ1 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Clec18aQ7TSQ1 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Clec18aQ7TSQ1 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Clec18aQ7TSQ1 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Clec18aQ7TSQ1 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Clec18aQ7TSQ1 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Clec18aQ7TSQ1 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Clec18aQ7TSQ1 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Clec18aQ7TSQ1 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Clec18aQ7TSQ1 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Clec18aQ7TSQ1 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Clec18aQ7TSQ1 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Clec18aQ7TSQ1 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Clec18aQ7TSQ1 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Clec18aQ7TSQ1 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Clec18aQ7TSQ1 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Clec18aQ7TSQ1 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Clec18aQ7TSQ1 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Clec18aQ7TSQ1 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Clec18aQ7TSQ1 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Clec18aQ7TSQ1 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Clec18aQ7TSQ1 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Clec18aQ7TSQ1 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Clec18aQ7TSQ1 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Clec18aQ7TSQ1 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Clec18aQ7TSQ1 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Clec18aQ7TSQ1 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Clec18aQ7TSQ1 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Clec18aQ7TSQ1 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Clec18aQ7TSQ1 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Clec18aQ7TSQ1 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Clec18aQ7TSQ1 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Clec18aQ7TSQ1 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Clec18aQ7TSQ1 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Clec18aQ7TSQ1 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Clec18aQ7TSQ1 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Clec18aQ7TSQ1 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
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Clec18aQ7TSQ1 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Clec18aQ7TSQ1 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Clec18aQ7TSQ1 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Clec18aQ7TSQ1 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Clec18aQ7TSQ1 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Clec18aQ7TSQ1 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Clec18aQ7TSQ1 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Clec18aQ7TSQ1 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Clec18aQ7TSQ1 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Clec18aQ7TSQ1 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Clec18aQ7TSQ1 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
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Clec18aQ7TSQ1 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Clec18aQ7TSQ1 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
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Clec18aQ7TSQ1 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Clec18aQ7TSQ1 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Clec18aQ7TSQ1 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Clec18aQ7TSQ1 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Clec18aQ7TSQ1 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Clec18aQ7TSQ1 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Clec18aQ7TSQ1 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Clec18aQ7TSQ1 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Clec18aQ7TSQ1 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Clec18aQ7TSQ1 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Clec18aQ7TSQ1 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Clec18aQ7TSQ1 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Clec18aQ7TSQ1 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Clec18aQ7TSQ1 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Clec18aQ7TSQ1 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Clec18aQ7TSQ1 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Clec18aQ7TSQ1 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Clec18aQ7TSQ1 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Clec18aQ7TSQ1 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Clec18aQ7TSQ1 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Clec18aQ7TSQ1 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Clec18aQ7TSQ1 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Clec18aQ7TSQ1 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Clec18aQ7TSQ1 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Clec18aQ7TSQ1 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Clec18aQ7TSQ1 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Clec18aQ7TSQ1 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Clec18aQ7TSQ1 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Clec18aQ7TSQ1 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Clec18aQ7TSQ1 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Clec18aQ7TSQ1 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Clec18aQ7TSQ1 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Clec18aQ7TSQ1 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Clec18aQ7TSQ1 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Clec18aQ7TSQ1 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
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