Protein–RNA interactions for Protein: Q7TQK5

Ccdc93, Coiled-coil domain-containing protein 93, mousemouse

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc93Q7TQK5 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc93Q7TQK5 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc93Q7TQK5 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc93Q7TQK5 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc93Q7TQK5 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc93Q7TQK5 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc93Q7TQK5 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc93Q7TQK5 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc93Q7TQK5 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc93Q7TQK5 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc93Q7TQK5 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc93Q7TQK5 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc93Q7TQK5 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc93Q7TQK5 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc93Q7TQK5 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc93Q7TQK5 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc93Q7TQK5 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc93Q7TQK5 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc93Q7TQK5 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc93Q7TQK5 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc93Q7TQK5 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc93Q7TQK5 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc93Q7TQK5 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc93Q7TQK5 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc93Q7TQK5 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc93Q7TQK5 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc93Q7TQK5 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc93Q7TQK5 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc93Q7TQK5 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc93Q7TQK5 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc93Q7TQK5 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc93Q7TQK5 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc93Q7TQK5 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc93Q7TQK5 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc93Q7TQK5 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc93Q7TQK5 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc93Q7TQK5 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc93Q7TQK5 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc93Q7TQK5 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc93Q7TQK5 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc93Q7TQK5 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc93Q7TQK5 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc93Q7TQK5 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc93Q7TQK5 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc93Q7TQK5 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc93Q7TQK5 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc93Q7TQK5 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc93Q7TQK5 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc93Q7TQK5 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc93Q7TQK5 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc93Q7TQK5 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc93Q7TQK5 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc93Q7TQK5 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc93Q7TQK5 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc93Q7TQK5 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc93Q7TQK5 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc93Q7TQK5 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc93Q7TQK5 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc93Q7TQK5 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc93Q7TQK5 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc93Q7TQK5 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc93Q7TQK5 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc93Q7TQK5 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc93Q7TQK5 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Ccdc93Q7TQK5 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc93Q7TQK5 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc93Q7TQK5 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc93Q7TQK5 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc93Q7TQK5 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc93Q7TQK5 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc93Q7TQK5 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc93Q7TQK5 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc93Q7TQK5 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc93Q7TQK5 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc93Q7TQK5 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc93Q7TQK5 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc93Q7TQK5 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc93Q7TQK5 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc93Q7TQK5 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc93Q7TQK5 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc93Q7TQK5 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc93Q7TQK5 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc93Q7TQK5 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc93Q7TQK5 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc93Q7TQK5 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc93Q7TQK5 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc93Q7TQK5 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc93Q7TQK5 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc93Q7TQK5 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc93Q7TQK5 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc93Q7TQK5 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc93Q7TQK5 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc93Q7TQK5 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc93Q7TQK5 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc93Q7TQK5 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc93Q7TQK5 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc93Q7TQK5 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc93Q7TQK5 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc93Q7TQK5 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccdc93Q7TQK5 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms