Protein–RNA interactions for Protein: Q78PY7

Snd1, Staphylococcal nuclease domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snd1Q78PY7 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Snd1Q78PY7 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Snd1Q78PY7 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Snd1Q78PY7 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Snd1Q78PY7 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Snd1Q78PY7 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Snd1Q78PY7 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Snd1Q78PY7 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Snd1Q78PY7 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Snd1Q78PY7 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Snd1Q78PY7 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Snd1Q78PY7 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Snd1Q78PY7 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Snd1Q78PY7 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Snd1Q78PY7 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Snd1Q78PY7 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Snd1Q78PY7 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Snd1Q78PY7 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Snd1Q78PY7 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Snd1Q78PY7 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Snd1Q78PY7 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Snd1Q78PY7 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Snd1Q78PY7 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Snd1Q78PY7 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Snd1Q78PY7 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Snd1Q78PY7 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Snd1Q78PY7 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Snd1Q78PY7 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Snd1Q78PY7 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Snd1Q78PY7 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Snd1Q78PY7 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Snd1Q78PY7 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Snd1Q78PY7 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Snd1Q78PY7 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Snd1Q78PY7 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Snd1Q78PY7 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Snd1Q78PY7 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Snd1Q78PY7 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Snd1Q78PY7 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Snd1Q78PY7 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Snd1Q78PY7 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Snd1Q78PY7 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Snd1Q78PY7 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Snd1Q78PY7 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Snd1Q78PY7 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Snd1Q78PY7 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Snd1Q78PY7 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Snd1Q78PY7 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Snd1Q78PY7 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Snd1Q78PY7 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Snd1Q78PY7 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Snd1Q78PY7 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Snd1Q78PY7 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Snd1Q78PY7 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Snd1Q78PY7 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Snd1Q78PY7 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Snd1Q78PY7 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Snd1Q78PY7 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Snd1Q78PY7 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Snd1Q78PY7 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Snd1Q78PY7 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Snd1Q78PY7 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Snd1Q78PY7 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Snd1Q78PY7 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Snd1Q78PY7 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Snd1Q78PY7 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Snd1Q78PY7 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Snd1Q78PY7 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Snd1Q78PY7 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Snd1Q78PY7 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Snd1Q78PY7 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Snd1Q78PY7 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Snd1Q78PY7 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Snd1Q78PY7 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Snd1Q78PY7 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Snd1Q78PY7 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Snd1Q78PY7 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Snd1Q78PY7 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Snd1Q78PY7 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Snd1Q78PY7 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Snd1Q78PY7 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Snd1Q78PY7 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Snd1Q78PY7 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Snd1Q78PY7 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Snd1Q78PY7 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Snd1Q78PY7 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Snd1Q78PY7 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Snd1Q78PY7 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Snd1Q78PY7 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Snd1Q78PY7 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Snd1Q78PY7 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Snd1Q78PY7 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Snd1Q78PY7 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Snd1Q78PY7 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Snd1Q78PY7 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Snd1Q78PY7 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Snd1Q78PY7 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Snd1Q78PY7 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Snd1Q78PY7 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Snd1Q78PY7 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 358.5 ms