Protein–RNA interactions for Protein: Q78KK3

Slc22a18, Solute carrier family 22 member 18, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc22a18Q78KK3 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc22a18Q78KK3 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc22a18Q78KK3 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc22a18Q78KK3 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc22a18Q78KK3 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc22a18Q78KK3 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc22a18Q78KK3 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc22a18Q78KK3 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc22a18Q78KK3 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc22a18Q78KK3 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc22a18Q78KK3 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc22a18Q78KK3 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slc22a18Q78KK3 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc22a18Q78KK3 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc22a18Q78KK3 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc22a18Q78KK3 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc22a18Q78KK3 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc22a18Q78KK3 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc22a18Q78KK3 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc22a18Q78KK3 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc22a18Q78KK3 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc22a18Q78KK3 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc22a18Q78KK3 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc22a18Q78KK3 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc22a18Q78KK3 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc22a18Q78KK3 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc22a18Q78KK3 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc22a18Q78KK3 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc22a18Q78KK3 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc22a18Q78KK3 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc22a18Q78KK3 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc22a18Q78KK3 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc22a18Q78KK3 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc22a18Q78KK3 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc22a18Q78KK3 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc22a18Q78KK3 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc22a18Q78KK3 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc22a18Q78KK3 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc22a18Q78KK3 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc22a18Q78KK3 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc22a18Q78KK3 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc22a18Q78KK3 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc22a18Q78KK3 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc22a18Q78KK3 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc22a18Q78KK3 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc22a18Q78KK3 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc22a18Q78KK3 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc22a18Q78KK3 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc22a18Q78KK3 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc22a18Q78KK3 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc22a18Q78KK3 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc22a18Q78KK3 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc22a18Q78KK3 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc22a18Q78KK3 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc22a18Q78KK3 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc22a18Q78KK3 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc22a18Q78KK3 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc22a18Q78KK3 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc22a18Q78KK3 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc22a18Q78KK3 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc22a18Q78KK3 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc22a18Q78KK3 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc22a18Q78KK3 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc22a18Q78KK3 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc22a18Q78KK3 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc22a18Q78KK3 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc22a18Q78KK3 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc22a18Q78KK3 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc22a18Q78KK3 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc22a18Q78KK3 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slc22a18Q78KK3 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slc22a18Q78KK3 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slc22a18Q78KK3 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slc22a18Q78KK3 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slc22a18Q78KK3 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slc22a18Q78KK3 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slc22a18Q78KK3 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slc22a18Q78KK3 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slc22a18Q78KK3 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slc22a18Q78KK3 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slc22a18Q78KK3 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Slc22a18Q78KK3 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Slc22a18Q78KK3 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Slc22a18Q78KK3 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Slc22a18Q78KK3 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Slc22a18Q78KK3 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Slc22a18Q78KK3 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Slc22a18Q78KK3 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Slc22a18Q78KK3 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Slc22a18Q78KK3 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Slc22a18Q78KK3 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Slc22a18Q78KK3 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Slc22a18Q78KK3 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Slc22a18Q78KK3 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Slc22a18Q78KK3 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Slc22a18Q78KK3 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Slc22a18Q78KK3 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Slc22a18Q78KK3 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Slc22a18Q78KK3 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Slc22a18Q78KK3 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 977 ms