Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWR6

Syne1, Nesprin-1, mousemouse

Predictions only

Length 8,799 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne1Q6ZWR6 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Syne1Q6ZWR6 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Syne1Q6ZWR6 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Syne1Q6ZWR6 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Syne1Q6ZWR6 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Syne1Q6ZWR6 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Syne1Q6ZWR6 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Syne1Q6ZWR6 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Syne1Q6ZWR6 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Syne1Q6ZWR6 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Syne1Q6ZWR6 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Syne1Q6ZWR6 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Syne1Q6ZWR6 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Syne1Q6ZWR6 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Syne1Q6ZWR6 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Syne1Q6ZWR6 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Syne1Q6ZWR6 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Syne1Q6ZWR6 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Syne1Q6ZWR6 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Syne1Q6ZWR6 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Syne1Q6ZWR6 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Syne1Q6ZWR6 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Syne1Q6ZWR6 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Syne1Q6ZWR6 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Syne1Q6ZWR6 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Syne1Q6ZWR6 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Syne1Q6ZWR6 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Syne1Q6ZWR6 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Syne1Q6ZWR6 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Syne1Q6ZWR6 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Syne1Q6ZWR6 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Syne1Q6ZWR6 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Syne1Q6ZWR6 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Syne1Q6ZWR6 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Syne1Q6ZWR6 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Syne1Q6ZWR6 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Syne1Q6ZWR6 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Syne1Q6ZWR6 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Syne1Q6ZWR6 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Syne1Q6ZWR6 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Syne1Q6ZWR6 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Syne1Q6ZWR6 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Syne1Q6ZWR6 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Syne1Q6ZWR6 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Syne1Q6ZWR6 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Syne1Q6ZWR6 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Syne1Q6ZWR6 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Syne1Q6ZWR6 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Syne1Q6ZWR6 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Syne1Q6ZWR6 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Syne1Q6ZWR6 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Syne1Q6ZWR6 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Syne1Q6ZWR6 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Syne1Q6ZWR6 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Syne1Q6ZWR6 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Syne1Q6ZWR6 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Syne1Q6ZWR6 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Syne1Q6ZWR6 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Syne1Q6ZWR6 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Syne1Q6ZWR6 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Syne1Q6ZWR6 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Syne1Q6ZWR6 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Syne1Q6ZWR6 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Syne1Q6ZWR6 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Syne1Q6ZWR6 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Syne1Q6ZWR6 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Syne1Q6ZWR6 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Syne1Q6ZWR6 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Syne1Q6ZWR6 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Syne1Q6ZWR6 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Syne1Q6ZWR6 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Syne1Q6ZWR6 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Syne1Q6ZWR6 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Syne1Q6ZWR6 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Syne1Q6ZWR6 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Syne1Q6ZWR6 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Syne1Q6ZWR6 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Syne1Q6ZWR6 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Syne1Q6ZWR6 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Syne1Q6ZWR6 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Syne1Q6ZWR6 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Syne1Q6ZWR6 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Syne1Q6ZWR6 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Syne1Q6ZWR6 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Syne1Q6ZWR6 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Syne1Q6ZWR6 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Syne1Q6ZWR6 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Syne1Q6ZWR6 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Syne1Q6ZWR6 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Syne1Q6ZWR6 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Syne1Q6ZWR6 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Syne1Q6ZWR6 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Syne1Q6ZWR6 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Syne1Q6ZWR6 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Syne1Q6ZWR6 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Syne1Q6ZWR6 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Syne1Q6ZWR6 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Syne1Q6ZWR6 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Syne1Q6ZWR6 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Syne1Q6ZWR6 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
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