Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ08

Cnot1, CCR4-NOT transcription complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot1Q6ZQ08 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cnot1Q6ZQ08 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cnot1Q6ZQ08 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cnot1Q6ZQ08 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cnot1Q6ZQ08 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Cnot1Q6ZQ08 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cnot1Q6ZQ08 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cnot1Q6ZQ08 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cnot1Q6ZQ08 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cnot1Q6ZQ08 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cnot1Q6ZQ08 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cnot1Q6ZQ08 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cnot1Q6ZQ08 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cnot1Q6ZQ08 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cnot1Q6ZQ08 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cnot1Q6ZQ08 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Cnot1Q6ZQ08 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Cnot1Q6ZQ08 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Cnot1Q6ZQ08 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Cnot1Q6ZQ08 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Cnot1Q6ZQ08 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Cnot1Q6ZQ08 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Cnot1Q6ZQ08 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Cnot1Q6ZQ08 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cnot1Q6ZQ08 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cnot1Q6ZQ08 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cnot1Q6ZQ08 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cnot1Q6ZQ08 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cnot1Q6ZQ08 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cnot1Q6ZQ08 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cnot1Q6ZQ08 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cnot1Q6ZQ08 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cnot1Q6ZQ08 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cnot1Q6ZQ08 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cnot1Q6ZQ08 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cnot1Q6ZQ08 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cnot1Q6ZQ08 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cnot1Q6ZQ08 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cnot1Q6ZQ08 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cnot1Q6ZQ08 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cnot1Q6ZQ08 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cnot1Q6ZQ08 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Cnot1Q6ZQ08 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Cnot1Q6ZQ08 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cnot1Q6ZQ08 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Cnot1Q6ZQ08 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Cnot1Q6ZQ08 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cnot1Q6ZQ08 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cnot1Q6ZQ08 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cnot1Q6ZQ08 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cnot1Q6ZQ08 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Cnot1Q6ZQ08 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cnot1Q6ZQ08 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cnot1Q6ZQ08 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cnot1Q6ZQ08 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cnot1Q6ZQ08 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cnot1Q6ZQ08 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cnot1Q6ZQ08 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cnot1Q6ZQ08 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cnot1Q6ZQ08 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cnot1Q6ZQ08 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cnot1Q6ZQ08 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cnot1Q6ZQ08 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cnot1Q6ZQ08 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Cnot1Q6ZQ08 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cnot1Q6ZQ08 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cnot1Q6ZQ08 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cnot1Q6ZQ08 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cnot1Q6ZQ08 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cnot1Q6ZQ08 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
Cnot1Q6ZQ08 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cnot1Q6ZQ08 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cnot1Q6ZQ08 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cnot1Q6ZQ08 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cnot1Q6ZQ08 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cnot1Q6ZQ08 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cnot1Q6ZQ08 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cnot1Q6ZQ08 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Cnot1Q6ZQ08 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cnot1Q6ZQ08 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cnot1Q6ZQ08 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cnot1Q6ZQ08 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cnot1Q6ZQ08 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cnot1Q6ZQ08 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cnot1Q6ZQ08 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cnot1Q6ZQ08 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Cnot1Q6ZQ08 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cnot1Q6ZQ08 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cnot1Q6ZQ08 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cnot1Q6ZQ08 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cnot1Q6ZQ08 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cnot1Q6ZQ08 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cnot1Q6ZQ08 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Cnot1Q6ZQ08 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cnot1Q6ZQ08 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cnot1Q6ZQ08 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cnot1Q6ZQ08 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cnot1Q6ZQ08 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Cnot1Q6ZQ08 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cnot1Q6ZQ08 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms