Protein–RNA interactions for Protein: Q6UQ17

Atp8b3, Phospholipid-transporting ATPase IK, mousemouse

Predictions only

Length 1,335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b3Q6UQ17 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Atp8b3Q6UQ17 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Atp8b3Q6UQ17 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Atp8b3Q6UQ17 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Atp8b3Q6UQ17 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Atp8b3Q6UQ17 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Atp8b3Q6UQ17 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Atp8b3Q6UQ17 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Atp8b3Q6UQ17 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Atp8b3Q6UQ17 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Atp8b3Q6UQ17 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Atp8b3Q6UQ17 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Atp8b3Q6UQ17 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Atp8b3Q6UQ17 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Atp8b3Q6UQ17 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Atp8b3Q6UQ17 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Atp8b3Q6UQ17 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Atp8b3Q6UQ17 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Atp8b3Q6UQ17 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Atp8b3Q6UQ17 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Atp8b3Q6UQ17 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Atp8b3Q6UQ17 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Atp8b3Q6UQ17 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Atp8b3Q6UQ17 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Atp8b3Q6UQ17 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Atp8b3Q6UQ17 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Atp8b3Q6UQ17 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Atp8b3Q6UQ17 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Atp8b3Q6UQ17 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Atp8b3Q6UQ17 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Atp8b3Q6UQ17 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Atp8b3Q6UQ17 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Atp8b3Q6UQ17 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Atp8b3Q6UQ17 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Atp8b3Q6UQ17 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Atp8b3Q6UQ17 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Atp8b3Q6UQ17 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Atp8b3Q6UQ17 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Atp8b3Q6UQ17 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Atp8b3Q6UQ17 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Atp8b3Q6UQ17 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Atp8b3Q6UQ17 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Atp8b3Q6UQ17 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Atp8b3Q6UQ17 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Atp8b3Q6UQ17 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Atp8b3Q6UQ17 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Atp8b3Q6UQ17 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Atp8b3Q6UQ17 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Atp8b3Q6UQ17 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Atp8b3Q6UQ17 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Atp8b3Q6UQ17 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Atp8b3Q6UQ17 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Atp8b3Q6UQ17 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Atp8b3Q6UQ17 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Atp8b3Q6UQ17 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Atp8b3Q6UQ17 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Atp8b3Q6UQ17 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Atp8b3Q6UQ17 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Atp8b3Q6UQ17 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Atp8b3Q6UQ17 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Atp8b3Q6UQ17 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Atp8b3Q6UQ17 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Atp8b3Q6UQ17 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Atp8b3Q6UQ17 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Atp8b3Q6UQ17 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Atp8b3Q6UQ17 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Atp8b3Q6UQ17 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Atp8b3Q6UQ17 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Atp8b3Q6UQ17 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Atp8b3Q6UQ17 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Atp8b3Q6UQ17 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Atp8b3Q6UQ17 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Atp8b3Q6UQ17 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Atp8b3Q6UQ17 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Atp8b3Q6UQ17 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Atp8b3Q6UQ17 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Atp8b3Q6UQ17 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Atp8b3Q6UQ17 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Atp8b3Q6UQ17 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Atp8b3Q6UQ17 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Atp8b3Q6UQ17 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Atp8b3Q6UQ17 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Atp8b3Q6UQ17 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Atp8b3Q6UQ17 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Atp8b3Q6UQ17 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Atp8b3Q6UQ17 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Atp8b3Q6UQ17 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Atp8b3Q6UQ17 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Atp8b3Q6UQ17 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Atp8b3Q6UQ17 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Atp8b3Q6UQ17 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Atp8b3Q6UQ17 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Atp8b3Q6UQ17 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Atp8b3Q6UQ17 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Atp8b3Q6UQ17 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Atp8b3Q6UQ17 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Atp8b3Q6UQ17 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Atp8b3Q6UQ17 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Atp8b3Q6UQ17 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Atp8b3Q6UQ17 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms