Protein–RNA interactions for Protein: Q6RKD8

Flrt1, Leucine-rich repeat transmembrane protein FLRT1, mousemouse

Predictions only

Length 674 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Flrt1Q6RKD8 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Flrt1Q6RKD8 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Flrt1Q6RKD8 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Flrt1Q6RKD8 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Flrt1Q6RKD8 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Flrt1Q6RKD8 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Flrt1Q6RKD8 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Flrt1Q6RKD8 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Flrt1Q6RKD8 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Flrt1Q6RKD8 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Flrt1Q6RKD8 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Flrt1Q6RKD8 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Flrt1Q6RKD8 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Flrt1Q6RKD8 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Flrt1Q6RKD8 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Flrt1Q6RKD8 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Flrt1Q6RKD8 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Flrt1Q6RKD8 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Flrt1Q6RKD8 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Flrt1Q6RKD8 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Flrt1Q6RKD8 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Flrt1Q6RKD8 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Flrt1Q6RKD8 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Flrt1Q6RKD8 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Flrt1Q6RKD8 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Flrt1Q6RKD8 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Flrt1Q6RKD8 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Flrt1Q6RKD8 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Flrt1Q6RKD8 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Flrt1Q6RKD8 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Flrt1Q6RKD8 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Flrt1Q6RKD8 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Flrt1Q6RKD8 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Flrt1Q6RKD8 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Flrt1Q6RKD8 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Flrt1Q6RKD8 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Flrt1Q6RKD8 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Flrt1Q6RKD8 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Flrt1Q6RKD8 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Flrt1Q6RKD8 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Flrt1Q6RKD8 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Flrt1Q6RKD8 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Flrt1Q6RKD8 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Flrt1Q6RKD8 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Flrt1Q6RKD8 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Flrt1Q6RKD8 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Flrt1Q6RKD8 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Flrt1Q6RKD8 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Flrt1Q6RKD8 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Flrt1Q6RKD8 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Flrt1Q6RKD8 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Flrt1Q6RKD8 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Flrt1Q6RKD8 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Flrt1Q6RKD8 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Flrt1Q6RKD8 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Flrt1Q6RKD8 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Flrt1Q6RKD8 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Flrt1Q6RKD8 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Flrt1Q6RKD8 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Flrt1Q6RKD8 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Flrt1Q6RKD8 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Flrt1Q6RKD8 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Flrt1Q6RKD8 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Flrt1Q6RKD8 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Flrt1Q6RKD8 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Flrt1Q6RKD8 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Flrt1Q6RKD8 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Flrt1Q6RKD8 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Flrt1Q6RKD8 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Flrt1Q6RKD8 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Flrt1Q6RKD8 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Flrt1Q6RKD8 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Flrt1Q6RKD8 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Flrt1Q6RKD8 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Flrt1Q6RKD8 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Flrt1Q6RKD8 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Flrt1Q6RKD8 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Flrt1Q6RKD8 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Flrt1Q6RKD8 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Flrt1Q6RKD8 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Flrt1Q6RKD8 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Flrt1Q6RKD8 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Flrt1Q6RKD8 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Flrt1Q6RKD8 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Flrt1Q6RKD8 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Flrt1Q6RKD8 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Flrt1Q6RKD8 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Flrt1Q6RKD8 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Flrt1Q6RKD8 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Flrt1Q6RKD8 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Flrt1Q6RKD8 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Flrt1Q6RKD8 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Flrt1Q6RKD8 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Flrt1Q6RKD8 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Flrt1Q6RKD8 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Flrt1Q6RKD8 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Flrt1Q6RKD8 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Flrt1Q6RKD8 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Flrt1Q6RKD8 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Flrt1Q6RKD8 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms