Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFQ7

Rasa4, Ras GTPase-activating protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 802 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rasa4Q6PFQ7 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rasa4Q6PFQ7 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rasa4Q6PFQ7 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rasa4Q6PFQ7 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rasa4Q6PFQ7 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rasa4Q6PFQ7 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rasa4Q6PFQ7 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rasa4Q6PFQ7 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rasa4Q6PFQ7 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rasa4Q6PFQ7 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Rasa4Q6PFQ7 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
Rasa4Q6PFQ7 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Rasa4Q6PFQ7 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rasa4Q6PFQ7 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rasa4Q6PFQ7 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rasa4Q6PFQ7 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rasa4Q6PFQ7 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rasa4Q6PFQ7 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rasa4Q6PFQ7 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rasa4Q6PFQ7 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rasa4Q6PFQ7 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rasa4Q6PFQ7 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rasa4Q6PFQ7 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rasa4Q6PFQ7 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rasa4Q6PFQ7 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rasa4Q6PFQ7 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rasa4Q6PFQ7 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rasa4Q6PFQ7 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rasa4Q6PFQ7 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rasa4Q6PFQ7 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rasa4Q6PFQ7 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rasa4Q6PFQ7 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rasa4Q6PFQ7 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rasa4Q6PFQ7 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rasa4Q6PFQ7 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rasa4Q6PFQ7 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rasa4Q6PFQ7 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rasa4Q6PFQ7 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rasa4Q6PFQ7 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rasa4Q6PFQ7 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rasa4Q6PFQ7 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rasa4Q6PFQ7 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rasa4Q6PFQ7 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rasa4Q6PFQ7 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Rasa4Q6PFQ7 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rasa4Q6PFQ7 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rasa4Q6PFQ7 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Rasa4Q6PFQ7 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rasa4Q6PFQ7 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rasa4Q6PFQ7 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rasa4Q6PFQ7 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rasa4Q6PFQ7 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rasa4Q6PFQ7 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rasa4Q6PFQ7 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Rasa4Q6PFQ7 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rasa4Q6PFQ7 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rasa4Q6PFQ7 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rasa4Q6PFQ7 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rasa4Q6PFQ7 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rasa4Q6PFQ7 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rasa4Q6PFQ7 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rasa4Q6PFQ7 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rasa4Q6PFQ7 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rasa4Q6PFQ7 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rasa4Q6PFQ7 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rasa4Q6PFQ7 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rasa4Q6PFQ7 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rasa4Q6PFQ7 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rasa4Q6PFQ7 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rasa4Q6PFQ7 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rasa4Q6PFQ7 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rasa4Q6PFQ7 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rasa4Q6PFQ7 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rasa4Q6PFQ7 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Rasa4Q6PFQ7 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rasa4Q6PFQ7 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rasa4Q6PFQ7 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rasa4Q6PFQ7 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rasa4Q6PFQ7 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rasa4Q6PFQ7 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Rasa4Q6PFQ7 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rasa4Q6PFQ7 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rasa4Q6PFQ7 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rasa4Q6PFQ7 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rasa4Q6PFQ7 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rasa4Q6PFQ7 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rasa4Q6PFQ7 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rasa4Q6PFQ7 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rasa4Q6PFQ7 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rasa4Q6PFQ7 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Rasa4Q6PFQ7 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rasa4Q6PFQ7 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rasa4Q6PFQ7 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rasa4Q6PFQ7 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rasa4Q6PFQ7 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rasa4Q6PFQ7 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rasa4Q6PFQ7 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rasa4Q6PFQ7 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rasa4Q6PFQ7 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rasa4Q6PFQ7 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms