Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDI5

Ecm29, Proteasome-associated protein ECM29 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,840 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecm29Q6PDI5 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ecm29Q6PDI5 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ecm29Q6PDI5 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ecm29Q6PDI5 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ecm29Q6PDI5 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ecm29Q6PDI5 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ecm29Q6PDI5 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ecm29Q6PDI5 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ecm29Q6PDI5 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ecm29Q6PDI5 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ecm29Q6PDI5 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ecm29Q6PDI5 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ecm29Q6PDI5 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ecm29Q6PDI5 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Ecm29Q6PDI5 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Ecm29Q6PDI5 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Ecm29Q6PDI5 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ecm29Q6PDI5 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ecm29Q6PDI5 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ecm29Q6PDI5 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ecm29Q6PDI5 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ecm29Q6PDI5 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ecm29Q6PDI5 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ecm29Q6PDI5 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ecm29Q6PDI5 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ecm29Q6PDI5 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ecm29Q6PDI5 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ecm29Q6PDI5 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ecm29Q6PDI5 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ecm29Q6PDI5 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ecm29Q6PDI5 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ecm29Q6PDI5 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ecm29Q6PDI5 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ecm29Q6PDI5 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ecm29Q6PDI5 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ecm29Q6PDI5 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ecm29Q6PDI5 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Ecm29Q6PDI5 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ecm29Q6PDI5 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ecm29Q6PDI5 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ecm29Q6PDI5 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ecm29Q6PDI5 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Ecm29Q6PDI5 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ecm29Q6PDI5 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ecm29Q6PDI5 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ecm29Q6PDI5 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ecm29Q6PDI5 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ecm29Q6PDI5 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Ecm29Q6PDI5 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ecm29Q6PDI5 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ecm29Q6PDI5 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ecm29Q6PDI5 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ecm29Q6PDI5 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ecm29Q6PDI5 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ecm29Q6PDI5 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ecm29Q6PDI5 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
Ecm29Q6PDI5 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ecm29Q6PDI5 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ecm29Q6PDI5 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ecm29Q6PDI5 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ecm29Q6PDI5 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ecm29Q6PDI5 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Ecm29Q6PDI5 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ecm29Q6PDI5 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ecm29Q6PDI5 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ecm29Q6PDI5 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ecm29Q6PDI5 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ecm29Q6PDI5 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ecm29Q6PDI5 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ecm29Q6PDI5 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ecm29Q6PDI5 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ecm29Q6PDI5 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ecm29Q6PDI5 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ecm29Q6PDI5 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ecm29Q6PDI5 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ecm29Q6PDI5 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ecm29Q6PDI5 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ecm29Q6PDI5 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ecm29Q6PDI5 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ecm29Q6PDI5 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ecm29Q6PDI5 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ecm29Q6PDI5 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ecm29Q6PDI5 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Ecm29Q6PDI5 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Ecm29Q6PDI5 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ecm29Q6PDI5 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ecm29Q6PDI5 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ecm29Q6PDI5 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Ecm29Q6PDI5 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ecm29Q6PDI5 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ecm29Q6PDI5 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ecm29Q6PDI5 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ecm29Q6PDI5 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ecm29Q6PDI5 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Ecm29Q6PDI5 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ecm29Q6PDI5 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ecm29Q6PDI5 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ecm29Q6PDI5 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Ecm29Q6PDI5 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ecm29Q6PDI5 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms