Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5H2

Nes, Nestin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,864 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NesQ6P5H2 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NesQ6P5H2 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NesQ6P5H2 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NesQ6P5H2 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NesQ6P5H2 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NesQ6P5H2 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NesQ6P5H2 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NesQ6P5H2 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
NesQ6P5H2 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NesQ6P5H2 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NesQ6P5H2 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NesQ6P5H2 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NesQ6P5H2 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NesQ6P5H2 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
NesQ6P5H2 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NesQ6P5H2 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NesQ6P5H2 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NesQ6P5H2 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NesQ6P5H2 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NesQ6P5H2 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NesQ6P5H2 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NesQ6P5H2 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NesQ6P5H2 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
NesQ6P5H2 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NesQ6P5H2 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NesQ6P5H2 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NesQ6P5H2 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NesQ6P5H2 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NesQ6P5H2 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NesQ6P5H2 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NesQ6P5H2 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NesQ6P5H2 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NesQ6P5H2 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NesQ6P5H2 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NesQ6P5H2 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NesQ6P5H2 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NesQ6P5H2 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NesQ6P5H2 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
NesQ6P5H2 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NesQ6P5H2 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NesQ6P5H2 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NesQ6P5H2 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NesQ6P5H2 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NesQ6P5H2 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NesQ6P5H2 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NesQ6P5H2 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NesQ6P5H2 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NesQ6P5H2 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NesQ6P5H2 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NesQ6P5H2 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NesQ6P5H2 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NesQ6P5H2 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NesQ6P5H2 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NesQ6P5H2 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NesQ6P5H2 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NesQ6P5H2 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NesQ6P5H2 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NesQ6P5H2 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NesQ6P5H2 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NesQ6P5H2 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NesQ6P5H2 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NesQ6P5H2 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NesQ6P5H2 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NesQ6P5H2 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NesQ6P5H2 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NesQ6P5H2 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NesQ6P5H2 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NesQ6P5H2 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NesQ6P5H2 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NesQ6P5H2 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NesQ6P5H2 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NesQ6P5H2 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NesQ6P5H2 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
NesQ6P5H2 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NesQ6P5H2 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NesQ6P5H2 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NesQ6P5H2 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NesQ6P5H2 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NesQ6P5H2 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NesQ6P5H2 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NesQ6P5H2 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
NesQ6P5H2 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
NesQ6P5H2 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
NesQ6P5H2 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NesQ6P5H2 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NesQ6P5H2 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NesQ6P5H2 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NesQ6P5H2 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NesQ6P5H2 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NesQ6P5H2 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
NesQ6P5H2 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
NesQ6P5H2 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NesQ6P5H2 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NesQ6P5H2 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NesQ6P5H2 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NesQ6P5H2 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NesQ6P5H2 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NesQ6P5H2 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NesQ6P5H2 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NesQ6P5H2 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms