Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5D8

Smchd1, Structural maintenance of chromosomes flexible hinge domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,007 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smchd1Q6P5D8 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Smchd1Q6P5D8 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Smchd1Q6P5D8 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Smchd1Q6P5D8 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Smchd1Q6P5D8 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Smchd1Q6P5D8 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Smchd1Q6P5D8 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Smchd1Q6P5D8 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Smchd1Q6P5D8 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Smchd1Q6P5D8 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Smchd1Q6P5D8 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Smchd1Q6P5D8 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Smchd1Q6P5D8 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Smchd1Q6P5D8 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Smchd1Q6P5D8 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Smchd1Q6P5D8 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Smchd1Q6P5D8 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Smchd1Q6P5D8 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Smchd1Q6P5D8 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Smchd1Q6P5D8 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Smchd1Q6P5D8 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Smchd1Q6P5D8 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Smchd1Q6P5D8 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Smchd1Q6P5D8 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Smchd1Q6P5D8 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Smchd1Q6P5D8 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Smchd1Q6P5D8 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Smchd1Q6P5D8 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Smchd1Q6P5D8 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Smchd1Q6P5D8 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Smchd1Q6P5D8 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Smchd1Q6P5D8 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Smchd1Q6P5D8 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Smchd1Q6P5D8 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Smchd1Q6P5D8 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Smchd1Q6P5D8 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Smchd1Q6P5D8 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Smchd1Q6P5D8 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Smchd1Q6P5D8 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Smchd1Q6P5D8 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Smchd1Q6P5D8 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Smchd1Q6P5D8 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Smchd1Q6P5D8 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Smchd1Q6P5D8 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Smchd1Q6P5D8 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Smchd1Q6P5D8 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Smchd1Q6P5D8 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Smchd1Q6P5D8 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Smchd1Q6P5D8 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Smchd1Q6P5D8 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Smchd1Q6P5D8 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Smchd1Q6P5D8 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Smchd1Q6P5D8 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Smchd1Q6P5D8 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Smchd1Q6P5D8 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Smchd1Q6P5D8 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Smchd1Q6P5D8 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Smchd1Q6P5D8 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Smchd1Q6P5D8 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Smchd1Q6P5D8 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Smchd1Q6P5D8 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Smchd1Q6P5D8 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Smchd1Q6P5D8 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Smchd1Q6P5D8 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Smchd1Q6P5D8 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Smchd1Q6P5D8 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Smchd1Q6P5D8 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Smchd1Q6P5D8 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Smchd1Q6P5D8 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Smchd1Q6P5D8 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Smchd1Q6P5D8 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Smchd1Q6P5D8 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Smchd1Q6P5D8 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Smchd1Q6P5D8 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Smchd1Q6P5D8 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Smchd1Q6P5D8 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Smchd1Q6P5D8 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Smchd1Q6P5D8 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Smchd1Q6P5D8 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Smchd1Q6P5D8 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Smchd1Q6P5D8 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Smchd1Q6P5D8 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Smchd1Q6P5D8 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Smchd1Q6P5D8 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Smchd1Q6P5D8 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Smchd1Q6P5D8 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Smchd1Q6P5D8 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Smchd1Q6P5D8 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Smchd1Q6P5D8 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Smchd1Q6P5D8 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Smchd1Q6P5D8 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Smchd1Q6P5D8 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Smchd1Q6P5D8 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Smchd1Q6P5D8 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Smchd1Q6P5D8 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Smchd1Q6P5D8 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Smchd1Q6P5D8 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Smchd1Q6P5D8 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Smchd1Q6P5D8 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Smchd1Q6P5D8 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms