Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1Y1

Rtl3, Retrotransposon Gag-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl3Q6P1Y1 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rtl3Q6P1Y1 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rtl3Q6P1Y1 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rtl3Q6P1Y1 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rtl3Q6P1Y1 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rtl3Q6P1Y1 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rtl3Q6P1Y1 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rtl3Q6P1Y1 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rtl3Q6P1Y1 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rtl3Q6P1Y1 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Rtl3Q6P1Y1 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rtl3Q6P1Y1 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rtl3Q6P1Y1 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rtl3Q6P1Y1 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rtl3Q6P1Y1 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rtl3Q6P1Y1 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rtl3Q6P1Y1 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rtl3Q6P1Y1 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rtl3Q6P1Y1 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rtl3Q6P1Y1 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rtl3Q6P1Y1 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rtl3Q6P1Y1 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rtl3Q6P1Y1 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rtl3Q6P1Y1 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rtl3Q6P1Y1 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rtl3Q6P1Y1 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Rtl3Q6P1Y1 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rtl3Q6P1Y1 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rtl3Q6P1Y1 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rtl3Q6P1Y1 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rtl3Q6P1Y1 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rtl3Q6P1Y1 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rtl3Q6P1Y1 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rtl3Q6P1Y1 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rtl3Q6P1Y1 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rtl3Q6P1Y1 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rtl3Q6P1Y1 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rtl3Q6P1Y1 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Rtl3Q6P1Y1 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rtl3Q6P1Y1 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rtl3Q6P1Y1 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rtl3Q6P1Y1 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rtl3Q6P1Y1 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rtl3Q6P1Y1 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rtl3Q6P1Y1 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rtl3Q6P1Y1 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rtl3Q6P1Y1 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rtl3Q6P1Y1 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rtl3Q6P1Y1 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rtl3Q6P1Y1 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rtl3Q6P1Y1 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rtl3Q6P1Y1 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rtl3Q6P1Y1 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rtl3Q6P1Y1 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rtl3Q6P1Y1 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rtl3Q6P1Y1 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rtl3Q6P1Y1 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rtl3Q6P1Y1 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rtl3Q6P1Y1 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rtl3Q6P1Y1 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rtl3Q6P1Y1 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rtl3Q6P1Y1 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rtl3Q6P1Y1 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rtl3Q6P1Y1 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rtl3Q6P1Y1 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rtl3Q6P1Y1 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rtl3Q6P1Y1 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rtl3Q6P1Y1 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rtl3Q6P1Y1 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rtl3Q6P1Y1 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rtl3Q6P1Y1 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rtl3Q6P1Y1 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rtl3Q6P1Y1 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rtl3Q6P1Y1 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rtl3Q6P1Y1 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rtl3Q6P1Y1 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rtl3Q6P1Y1 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rtl3Q6P1Y1 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rtl3Q6P1Y1 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rtl3Q6P1Y1 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rtl3Q6P1Y1 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Rtl3Q6P1Y1 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rtl3Q6P1Y1 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rtl3Q6P1Y1 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Rtl3Q6P1Y1 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rtl3Q6P1Y1 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rtl3Q6P1Y1 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rtl3Q6P1Y1 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rtl3Q6P1Y1 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rtl3Q6P1Y1 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rtl3Q6P1Y1 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rtl3Q6P1Y1 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rtl3Q6P1Y1 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rtl3Q6P1Y1 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rtl3Q6P1Y1 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rtl3Q6P1Y1 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rtl3Q6P1Y1 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rtl3Q6P1Y1 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rtl3Q6P1Y1 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rtl3Q6P1Y1 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms