Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE9

Tshz2, Teashirt homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,030 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tshz2Q68FE9 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tshz2Q68FE9 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tshz2Q68FE9 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tshz2Q68FE9 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tshz2Q68FE9 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tshz2Q68FE9 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tshz2Q68FE9 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tshz2Q68FE9 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tshz2Q68FE9 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tshz2Q68FE9 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tshz2Q68FE9 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tshz2Q68FE9 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tshz2Q68FE9 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tshz2Q68FE9 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tshz2Q68FE9 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tshz2Q68FE9 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tshz2Q68FE9 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tshz2Q68FE9 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tshz2Q68FE9 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tshz2Q68FE9 4930412F09Rik-201ENSMUST00000139006 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tshz2Q68FE9 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tshz2Q68FE9 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tshz2Q68FE9 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tshz2Q68FE9 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tshz2Q68FE9 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Tshz2Q68FE9 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tshz2Q68FE9 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tshz2Q68FE9 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tshz2Q68FE9 Gm37319-201ENSMUST00000193500 636 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Tshz2Q68FE9 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tshz2Q68FE9 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tshz2Q68FE9 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tshz2Q68FE9 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tshz2Q68FE9 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tshz2Q68FE9 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tshz2Q68FE9 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tshz2Q68FE9 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tshz2Q68FE9 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tshz2Q68FE9 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tshz2Q68FE9 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tshz2Q68FE9 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tshz2Q68FE9 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tshz2Q68FE9 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tshz2Q68FE9 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tshz2Q68FE9 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Tshz2Q68FE9 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tshz2Q68FE9 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Tshz2Q68FE9 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tshz2Q68FE9 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tshz2Q68FE9 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tshz2Q68FE9 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tshz2Q68FE9 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tshz2Q68FE9 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tshz2Q68FE9 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tshz2Q68FE9 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tshz2Q68FE9 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tshz2Q68FE9 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tshz2Q68FE9 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tshz2Q68FE9 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tshz2Q68FE9 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tshz2Q68FE9 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tshz2Q68FE9 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tshz2Q68FE9 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tshz2Q68FE9 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tshz2Q68FE9 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tshz2Q68FE9 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tshz2Q68FE9 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tshz2Q68FE9 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tshz2Q68FE9 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tshz2Q68FE9 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tshz2Q68FE9 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tshz2Q68FE9 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tshz2Q68FE9 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tshz2Q68FE9 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tshz2Q68FE9 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tshz2Q68FE9 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tshz2Q68FE9 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tshz2Q68FE9 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tshz2Q68FE9 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tshz2Q68FE9 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tshz2Q68FE9 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tshz2Q68FE9 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tshz2Q68FE9 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tshz2Q68FE9 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tshz2Q68FE9 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tshz2Q68FE9 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tshz2Q68FE9 Gm12106-201ENSMUST00000116006 1200 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Tshz2Q68FE9 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Tshz2Q68FE9 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tshz2Q68FE9 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tshz2Q68FE9 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tshz2Q68FE9 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tshz2Q68FE9 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tshz2Q68FE9 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tshz2Q68FE9 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tshz2Q68FE9 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Tshz2Q68FE9 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tshz2Q68FE9 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Tshz2Q68FE9 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tshz2Q68FE9 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms