Protein–RNA interactions for Protein: Q66JQ7

Knl1, Kinetochore scaffold 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Knl1Q66JQ7 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Knl1Q66JQ7 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Knl1Q66JQ7 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Knl1Q66JQ7 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC30.18■■■□□ 2.42
Knl1Q66JQ7 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Knl1Q66JQ7 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Knl1Q66JQ7 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Knl1Q66JQ7 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Knl1Q66JQ7 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Knl1Q66JQ7 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Knl1Q66JQ7 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Knl1Q66JQ7 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Knl1Q66JQ7 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Knl1Q66JQ7 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Knl1Q66JQ7 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Knl1Q66JQ7 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Knl1Q66JQ7 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Knl1Q66JQ7 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC30.14■■■□□ 2.42
Knl1Q66JQ7 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC30.14■■■□□ 2.42
Knl1Q66JQ7 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Knl1Q66JQ7 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Knl1Q66JQ7 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Knl1Q66JQ7 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC30.14■■■□□ 2.42
Knl1Q66JQ7 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Knl1Q66JQ7 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.41
Knl1Q66JQ7 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Knl1Q66JQ7 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Knl1Q66JQ7 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Knl1Q66JQ7 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Knl1Q66JQ7 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Knl1Q66JQ7 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Knl1Q66JQ7 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Knl1Q66JQ7 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Knl1Q66JQ7 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Knl1Q66JQ7 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Knl1Q66JQ7 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Knl1Q66JQ7 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Knl1Q66JQ7 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Knl1Q66JQ7 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Knl1Q66JQ7 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Knl1Q66JQ7 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Knl1Q66JQ7 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Knl1Q66JQ7 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
Knl1Q66JQ7 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Knl1Q66JQ7 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Knl1Q66JQ7 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
Knl1Q66JQ7 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Knl1Q66JQ7 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Knl1Q66JQ7 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Knl1Q66JQ7 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Knl1Q66JQ7 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Knl1Q66JQ7 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Knl1Q66JQ7 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
Knl1Q66JQ7 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Knl1Q66JQ7 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Knl1Q66JQ7 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Knl1Q66JQ7 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Knl1Q66JQ7 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Knl1Q66JQ7 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
Knl1Q66JQ7 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Knl1Q66JQ7 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
Knl1Q66JQ7 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Knl1Q66JQ7 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
Knl1Q66JQ7 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Knl1Q66JQ7 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Knl1Q66JQ7 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Knl1Q66JQ7 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Knl1Q66JQ7 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Knl1Q66JQ7 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Knl1Q66JQ7 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Knl1Q66JQ7 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Knl1Q66JQ7 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Knl1Q66JQ7 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Knl1Q66JQ7 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Knl1Q66JQ7 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Knl1Q66JQ7 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
Knl1Q66JQ7 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Knl1Q66JQ7 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
Knl1Q66JQ7 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
Knl1Q66JQ7 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Knl1Q66JQ7 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
Knl1Q66JQ7 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Knl1Q66JQ7 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC30■■■□□ 2.39
Knl1Q66JQ7 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC30■■■□□ 2.39
Knl1Q66JQ7 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Knl1Q66JQ7 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
Knl1Q66JQ7 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Knl1Q66JQ7 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Knl1Q66JQ7 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Knl1Q66JQ7 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Knl1Q66JQ7 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Knl1Q66JQ7 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Knl1Q66JQ7 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Knl1Q66JQ7 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Knl1Q66JQ7 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Knl1Q66JQ7 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Knl1Q66JQ7 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
Knl1Q66JQ7 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Knl1Q66JQ7 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Knl1Q66JQ7 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms