Protein–RNA interactions for Protein: Q61107

Gbp4, Guanylate-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp4Q61107 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gbp4Q61107 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gbp4Q61107 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Gbp4Q61107 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Gbp4Q61107 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Gbp4Q61107 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Gbp4Q61107 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gbp4Q61107 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gbp4Q61107 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gbp4Q61107 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gbp4Q61107 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gbp4Q61107 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gbp4Q61107 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gbp4Q61107 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gbp4Q61107 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gbp4Q61107 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gbp4Q61107 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gbp4Q61107 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gbp4Q61107 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gbp4Q61107 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gbp4Q61107 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gbp4Q61107 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gbp4Q61107 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Gbp4Q61107 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gbp4Q61107 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gbp4Q61107 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gbp4Q61107 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gbp4Q61107 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gbp4Q61107 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gbp4Q61107 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gbp4Q61107 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gbp4Q61107 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gbp4Q61107 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gbp4Q61107 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gbp4Q61107 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gbp4Q61107 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gbp4Q61107 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gbp4Q61107 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gbp4Q61107 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gbp4Q61107 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gbp4Q61107 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gbp4Q61107 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gbp4Q61107 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gbp4Q61107 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gbp4Q61107 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gbp4Q61107 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gbp4Q61107 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gbp4Q61107 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gbp4Q61107 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gbp4Q61107 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gbp4Q61107 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gbp4Q61107 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gbp4Q61107 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gbp4Q61107 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gbp4Q61107 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gbp4Q61107 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gbp4Q61107 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gbp4Q61107 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gbp4Q61107 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gbp4Q61107 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gbp4Q61107 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gbp4Q61107 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gbp4Q61107 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gbp4Q61107 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gbp4Q61107 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gbp4Q61107 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Gbp4Q61107 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gbp4Q61107 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gbp4Q61107 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gbp4Q61107 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gbp4Q61107 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gbp4Q61107 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gbp4Q61107 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gbp4Q61107 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gbp4Q61107 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gbp4Q61107 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gbp4Q61107 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gbp4Q61107 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gbp4Q61107 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gbp4Q61107 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gbp4Q61107 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gbp4Q61107 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gbp4Q61107 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gbp4Q61107 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gbp4Q61107 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gbp4Q61107 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gbp4Q61107 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gbp4Q61107 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gbp4Q61107 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gbp4Q61107 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gbp4Q61107 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gbp4Q61107 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gbp4Q61107 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gbp4Q61107 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gbp4Q61107 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gbp4Q61107 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gbp4Q61107 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gbp4Q61107 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gbp4Q61107 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gbp4Q61107 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms