Protein–RNA interactions for Protein: Q60753

Ctf1, Cardiotrophin-1, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctf1Q60753 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ctf1Q60753 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ctf1Q60753 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ctf1Q60753 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ctf1Q60753 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ctf1Q60753 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ctf1Q60753 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ctf1Q60753 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ctf1Q60753 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ctf1Q60753 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ctf1Q60753 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ctf1Q60753 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ctf1Q60753 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ctf1Q60753 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ctf1Q60753 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ctf1Q60753 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ctf1Q60753 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ctf1Q60753 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ctf1Q60753 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ctf1Q60753 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ctf1Q60753 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ctf1Q60753 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ctf1Q60753 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ctf1Q60753 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ctf1Q60753 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ctf1Q60753 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ctf1Q60753 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ctf1Q60753 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Ctf1Q60753 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ctf1Q60753 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ctf1Q60753 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ctf1Q60753 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ctf1Q60753 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ctf1Q60753 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ctf1Q60753 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ctf1Q60753 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ctf1Q60753 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ctf1Q60753 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ctf1Q60753 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ctf1Q60753 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ctf1Q60753 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ctf1Q60753 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ctf1Q60753 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ctf1Q60753 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ctf1Q60753 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ctf1Q60753 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ctf1Q60753 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ctf1Q60753 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ctf1Q60753 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ctf1Q60753 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ctf1Q60753 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ctf1Q60753 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ctf1Q60753 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ctf1Q60753 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ctf1Q60753 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ctf1Q60753 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ctf1Q60753 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ctf1Q60753 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ctf1Q60753 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ctf1Q60753 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ctf1Q60753 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ctf1Q60753 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ctf1Q60753 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ctf1Q60753 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ctf1Q60753 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ctf1Q60753 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ctf1Q60753 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ctf1Q60753 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ctf1Q60753 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ctf1Q60753 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ctf1Q60753 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Ctf1Q60753 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ctf1Q60753 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ctf1Q60753 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctf1Q60753 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctf1Q60753 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctf1Q60753 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctf1Q60753 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctf1Q60753 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctf1Q60753 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctf1Q60753 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ctf1Q60753 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ctf1Q60753 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ctf1Q60753 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ctf1Q60753 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ctf1Q60753 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ctf1Q60753 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ctf1Q60753 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ctf1Q60753 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Ctf1Q60753 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ctf1Q60753 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Ctf1Q60753 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ctf1Q60753 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ctf1Q60753 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctf1Q60753 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctf1Q60753 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ctf1Q60753 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctf1Q60753 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctf1Q60753 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ctf1Q60753 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms