Protein–RNA interactions for Protein: Q5U465

Ccdc125, Coiled-coil domain-containing protein 125, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc125Q5U465 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc125Q5U465 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc125Q5U465 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc125Q5U465 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc125Q5U465 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc125Q5U465 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc125Q5U465 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc125Q5U465 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc125Q5U465 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc125Q5U465 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc125Q5U465 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc125Q5U465 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc125Q5U465 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc125Q5U465 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc125Q5U465 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc125Q5U465 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc125Q5U465 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc125Q5U465 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc125Q5U465 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc125Q5U465 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc125Q5U465 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc125Q5U465 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc125Q5U465 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc125Q5U465 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc125Q5U465 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc125Q5U465 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc125Q5U465 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc125Q5U465 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc125Q5U465 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc125Q5U465 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc125Q5U465 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc125Q5U465 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc125Q5U465 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc125Q5U465 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc125Q5U465 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ccdc125Q5U465 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ccdc125Q5U465 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc125Q5U465 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc125Q5U465 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc125Q5U465 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc125Q5U465 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc125Q5U465 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc125Q5U465 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc125Q5U465 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc125Q5U465 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc125Q5U465 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc125Q5U465 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc125Q5U465 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc125Q5U465 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc125Q5U465 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc125Q5U465 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc125Q5U465 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc125Q5U465 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc125Q5U465 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc125Q5U465 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc125Q5U465 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc125Q5U465 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc125Q5U465 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc125Q5U465 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc125Q5U465 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc125Q5U465 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc125Q5U465 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc125Q5U465 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc125Q5U465 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc125Q5U465 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc125Q5U465 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc125Q5U465 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc125Q5U465 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc125Q5U465 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc125Q5U465 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc125Q5U465 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc125Q5U465 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc125Q5U465 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc125Q5U465 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc125Q5U465 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc125Q5U465 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc125Q5U465 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc125Q5U465 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc125Q5U465 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc125Q5U465 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc125Q5U465 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc125Q5U465 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc125Q5U465 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc125Q5U465 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc125Q5U465 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc125Q5U465 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc125Q5U465 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc125Q5U465 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc125Q5U465 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc125Q5U465 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc125Q5U465 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc125Q5U465 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc125Q5U465 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc125Q5U465 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc125Q5U465 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc125Q5U465 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc125Q5U465 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc125Q5U465 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc125Q5U465 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc125Q5U465 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms