Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW19

Cluh, Clustered mitochondria protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CluhQ5SW19 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CluhQ5SW19 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CluhQ5SW19 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CluhQ5SW19 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CluhQ5SW19 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CluhQ5SW19 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CluhQ5SW19 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CluhQ5SW19 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CluhQ5SW19 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CluhQ5SW19 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CluhQ5SW19 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CluhQ5SW19 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CluhQ5SW19 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CluhQ5SW19 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CluhQ5SW19 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CluhQ5SW19 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CluhQ5SW19 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CluhQ5SW19 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CluhQ5SW19 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CluhQ5SW19 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CluhQ5SW19 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CluhQ5SW19 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CluhQ5SW19 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CluhQ5SW19 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CluhQ5SW19 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CluhQ5SW19 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CluhQ5SW19 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CluhQ5SW19 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CluhQ5SW19 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CluhQ5SW19 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CluhQ5SW19 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CluhQ5SW19 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CluhQ5SW19 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CluhQ5SW19 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CluhQ5SW19 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CluhQ5SW19 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CluhQ5SW19 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CluhQ5SW19 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CluhQ5SW19 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CluhQ5SW19 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CluhQ5SW19 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CluhQ5SW19 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CluhQ5SW19 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CluhQ5SW19 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CluhQ5SW19 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CluhQ5SW19 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CluhQ5SW19 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CluhQ5SW19 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CluhQ5SW19 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CluhQ5SW19 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CluhQ5SW19 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CluhQ5SW19 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CluhQ5SW19 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CluhQ5SW19 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CluhQ5SW19 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CluhQ5SW19 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CluhQ5SW19 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CluhQ5SW19 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CluhQ5SW19 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CluhQ5SW19 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CluhQ5SW19 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CluhQ5SW19 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CluhQ5SW19 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CluhQ5SW19 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CluhQ5SW19 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CluhQ5SW19 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CluhQ5SW19 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CluhQ5SW19 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CluhQ5SW19 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CluhQ5SW19 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CluhQ5SW19 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CluhQ5SW19 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CluhQ5SW19 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CluhQ5SW19 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CluhQ5SW19 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CluhQ5SW19 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CluhQ5SW19 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CluhQ5SW19 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CluhQ5SW19 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CluhQ5SW19 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CluhQ5SW19 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CluhQ5SW19 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CluhQ5SW19 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CluhQ5SW19 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CluhQ5SW19 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CluhQ5SW19 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CluhQ5SW19 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CluhQ5SW19 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CluhQ5SW19 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CluhQ5SW19 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CluhQ5SW19 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CluhQ5SW19 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
CluhQ5SW19 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CluhQ5SW19 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CluhQ5SW19 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CluhQ5SW19 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CluhQ5SW19 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CluhQ5SW19 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CluhQ5SW19 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CluhQ5SW19 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.8 ms