Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSM3

Arhgap44, Rho GTPase-activating protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 814 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap44Q5SSM3 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Arhgap44Q5SSM3 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Arhgap44Q5SSM3 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Arhgap44Q5SSM3 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Arhgap44Q5SSM3 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Arhgap44Q5SSM3 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Arhgap44Q5SSM3 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Arhgap44Q5SSM3 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Arhgap44Q5SSM3 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Arhgap44Q5SSM3 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Arhgap44Q5SSM3 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Arhgap44Q5SSM3 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Arhgap44Q5SSM3 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Arhgap44Q5SSM3 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Arhgap44Q5SSM3 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Arhgap44Q5SSM3 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Arhgap44Q5SSM3 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Arhgap44Q5SSM3 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Arhgap44Q5SSM3 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Arhgap44Q5SSM3 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Arhgap44Q5SSM3 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Arhgap44Q5SSM3 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Arhgap44Q5SSM3 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Arhgap44Q5SSM3 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Arhgap44Q5SSM3 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Arhgap44Q5SSM3 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Arhgap44Q5SSM3 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Arhgap44Q5SSM3 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Arhgap44Q5SSM3 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Arhgap44Q5SSM3 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Arhgap44Q5SSM3 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Arhgap44Q5SSM3 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Arhgap44Q5SSM3 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Arhgap44Q5SSM3 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Arhgap44Q5SSM3 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Arhgap44Q5SSM3 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Arhgap44Q5SSM3 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Arhgap44Q5SSM3 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Arhgap44Q5SSM3 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Arhgap44Q5SSM3 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Arhgap44Q5SSM3 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Arhgap44Q5SSM3 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Arhgap44Q5SSM3 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Arhgap44Q5SSM3 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Arhgap44Q5SSM3 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Arhgap44Q5SSM3 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Arhgap44Q5SSM3 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Arhgap44Q5SSM3 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Arhgap44Q5SSM3 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Arhgap44Q5SSM3 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Arhgap44Q5SSM3 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Arhgap44Q5SSM3 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Arhgap44Q5SSM3 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Arhgap44Q5SSM3 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Arhgap44Q5SSM3 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Arhgap44Q5SSM3 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Arhgap44Q5SSM3 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Arhgap44Q5SSM3 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Arhgap44Q5SSM3 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Arhgap44Q5SSM3 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Arhgap44Q5SSM3 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Arhgap44Q5SSM3 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Arhgap44Q5SSM3 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Arhgap44Q5SSM3 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Arhgap44Q5SSM3 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Arhgap44Q5SSM3 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Arhgap44Q5SSM3 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Arhgap44Q5SSM3 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Arhgap44Q5SSM3 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Arhgap44Q5SSM3 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Arhgap44Q5SSM3 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Arhgap44Q5SSM3 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Arhgap44Q5SSM3 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Arhgap44Q5SSM3 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Arhgap44Q5SSM3 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Arhgap44Q5SSM3 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Arhgap44Q5SSM3 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Arhgap44Q5SSM3 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Arhgap44Q5SSM3 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Arhgap44Q5SSM3 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Arhgap44Q5SSM3 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Arhgap44Q5SSM3 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Arhgap44Q5SSM3 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Arhgap44Q5SSM3 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Arhgap44Q5SSM3 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Arhgap44Q5SSM3 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Arhgap44Q5SSM3 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Arhgap44Q5SSM3 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Arhgap44Q5SSM3 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Arhgap44Q5SSM3 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Arhgap44Q5SSM3 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Arhgap44Q5SSM3 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Arhgap44Q5SSM3 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Arhgap44Q5SSM3 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Arhgap44Q5SSM3 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Arhgap44Q5SSM3 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Arhgap44Q5SSM3 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Arhgap44Q5SSM3 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Arhgap44Q5SSM3 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Arhgap44Q5SSM3 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67 ms