Protein–RNA interactions for Protein: Q5RKS2

Smim7, Small integral membrane protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim7Q5RKS2 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smim7Q5RKS2 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smim7Q5RKS2 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smim7Q5RKS2 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smim7Q5RKS2 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smim7Q5RKS2 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smim7Q5RKS2 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smim7Q5RKS2 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smim7Q5RKS2 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smim7Q5RKS2 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smim7Q5RKS2 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smim7Q5RKS2 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smim7Q5RKS2 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smim7Q5RKS2 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smim7Q5RKS2 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smim7Q5RKS2 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smim7Q5RKS2 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smim7Q5RKS2 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smim7Q5RKS2 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smim7Q5RKS2 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smim7Q5RKS2 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smim7Q5RKS2 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smim7Q5RKS2 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smim7Q5RKS2 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smim7Q5RKS2 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smim7Q5RKS2 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smim7Q5RKS2 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smim7Q5RKS2 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Smim7Q5RKS2 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smim7Q5RKS2 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smim7Q5RKS2 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smim7Q5RKS2 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smim7Q5RKS2 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Smim7Q5RKS2 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smim7Q5RKS2 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smim7Q5RKS2 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smim7Q5RKS2 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smim7Q5RKS2 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smim7Q5RKS2 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smim7Q5RKS2 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smim7Q5RKS2 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smim7Q5RKS2 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smim7Q5RKS2 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smim7Q5RKS2 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smim7Q5RKS2 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smim7Q5RKS2 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smim7Q5RKS2 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smim7Q5RKS2 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smim7Q5RKS2 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smim7Q5RKS2 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smim7Q5RKS2 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smim7Q5RKS2 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smim7Q5RKS2 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smim7Q5RKS2 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smim7Q5RKS2 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smim7Q5RKS2 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smim7Q5RKS2 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smim7Q5RKS2 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smim7Q5RKS2 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smim7Q5RKS2 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smim7Q5RKS2 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smim7Q5RKS2 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smim7Q5RKS2 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smim7Q5RKS2 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smim7Q5RKS2 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smim7Q5RKS2 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smim7Q5RKS2 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smim7Q5RKS2 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smim7Q5RKS2 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smim7Q5RKS2 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smim7Q5RKS2 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smim7Q5RKS2 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smim7Q5RKS2 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smim7Q5RKS2 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smim7Q5RKS2 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smim7Q5RKS2 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smim7Q5RKS2 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smim7Q5RKS2 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Smim7Q5RKS2 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Smim7Q5RKS2 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smim7Q5RKS2 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smim7Q5RKS2 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smim7Q5RKS2 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Smim7Q5RKS2 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smim7Q5RKS2 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smim7Q5RKS2 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smim7Q5RKS2 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smim7Q5RKS2 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smim7Q5RKS2 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smim7Q5RKS2 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smim7Q5RKS2 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smim7Q5RKS2 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smim7Q5RKS2 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smim7Q5RKS2 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smim7Q5RKS2 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Smim7Q5RKS2 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Smim7Q5RKS2 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smim7Q5RKS2 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smim7Q5RKS2 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smim7Q5RKS2 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 148.6 ms