Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC9

Trim58, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM58, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim58Q5NCC9 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Trim58Q5NCC9 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Trim58Q5NCC9 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Trim58Q5NCC9 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Trim58Q5NCC9 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Trim58Q5NCC9 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Trim58Q5NCC9 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Trim58Q5NCC9 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Trim58Q5NCC9 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Trim58Q5NCC9 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Trim58Q5NCC9 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Trim58Q5NCC9 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Trim58Q5NCC9 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Trim58Q5NCC9 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Trim58Q5NCC9 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Trim58Q5NCC9 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Trim58Q5NCC9 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Trim58Q5NCC9 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Trim58Q5NCC9 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Trim58Q5NCC9 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Trim58Q5NCC9 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Trim58Q5NCC9 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Trim58Q5NCC9 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Trim58Q5NCC9 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Trim58Q5NCC9 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Trim58Q5NCC9 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Trim58Q5NCC9 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Trim58Q5NCC9 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Trim58Q5NCC9 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Trim58Q5NCC9 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Trim58Q5NCC9 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Trim58Q5NCC9 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Trim58Q5NCC9 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Trim58Q5NCC9 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Trim58Q5NCC9 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Trim58Q5NCC9 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Trim58Q5NCC9 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Trim58Q5NCC9 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Trim58Q5NCC9 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Trim58Q5NCC9 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Trim58Q5NCC9 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Trim58Q5NCC9 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Trim58Q5NCC9 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Trim58Q5NCC9 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Trim58Q5NCC9 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Trim58Q5NCC9 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Trim58Q5NCC9 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Trim58Q5NCC9 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Trim58Q5NCC9 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Trim58Q5NCC9 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Trim58Q5NCC9 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Trim58Q5NCC9 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Trim58Q5NCC9 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Trim58Q5NCC9 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Trim58Q5NCC9 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Trim58Q5NCC9 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Trim58Q5NCC9 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Trim58Q5NCC9 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Trim58Q5NCC9 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Trim58Q5NCC9 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Trim58Q5NCC9 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Trim58Q5NCC9 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Trim58Q5NCC9 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Trim58Q5NCC9 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Trim58Q5NCC9 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Trim58Q5NCC9 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Trim58Q5NCC9 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Trim58Q5NCC9 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Trim58Q5NCC9 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Trim58Q5NCC9 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Trim58Q5NCC9 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Trim58Q5NCC9 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Trim58Q5NCC9 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Trim58Q5NCC9 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Trim58Q5NCC9 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Trim58Q5NCC9 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Trim58Q5NCC9 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Trim58Q5NCC9 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Trim58Q5NCC9 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Trim58Q5NCC9 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Trim58Q5NCC9 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Trim58Q5NCC9 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Trim58Q5NCC9 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Trim58Q5NCC9 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Trim58Q5NCC9 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Trim58Q5NCC9 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Trim58Q5NCC9 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Trim58Q5NCC9 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Trim58Q5NCC9 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Trim58Q5NCC9 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Trim58Q5NCC9 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Trim58Q5NCC9 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Trim58Q5NCC9 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Trim58Q5NCC9 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Trim58Q5NCC9 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Trim58Q5NCC9 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Trim58Q5NCC9 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Trim58Q5NCC9 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Trim58Q5NCC9 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Trim58Q5NCC9 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms