Protein–RNA interactions for Protein: Q4PLS0

Nlrp2, NACHT, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,046 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp2Q4PLS0 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nlrp2Q4PLS0 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nlrp2Q4PLS0 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nlrp2Q4PLS0 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nlrp2Q4PLS0 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Nlrp2Q4PLS0 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nlrp2Q4PLS0 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nlrp2Q4PLS0 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nlrp2Q4PLS0 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nlrp2Q4PLS0 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nlrp2Q4PLS0 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nlrp2Q4PLS0 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nlrp2Q4PLS0 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nlrp2Q4PLS0 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Nlrp2Q4PLS0 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Nlrp2Q4PLS0 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Nlrp2Q4PLS0 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nlrp2Q4PLS0 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nlrp2Q4PLS0 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nlrp2Q4PLS0 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nlrp2Q4PLS0 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nlrp2Q4PLS0 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nlrp2Q4PLS0 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nlrp2Q4PLS0 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nlrp2Q4PLS0 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nlrp2Q4PLS0 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nlrp2Q4PLS0 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nlrp2Q4PLS0 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nlrp2Q4PLS0 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nlrp2Q4PLS0 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nlrp2Q4PLS0 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nlrp2Q4PLS0 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nlrp2Q4PLS0 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nlrp2Q4PLS0 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nlrp2Q4PLS0 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nlrp2Q4PLS0 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Nlrp2Q4PLS0 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nlrp2Q4PLS0 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nlrp2Q4PLS0 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Nlrp2Q4PLS0 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nlrp2Q4PLS0 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nlrp2Q4PLS0 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nlrp2Q4PLS0 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nlrp2Q4PLS0 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nlrp2Q4PLS0 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nlrp2Q4PLS0 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nlrp2Q4PLS0 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nlrp2Q4PLS0 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nlrp2Q4PLS0 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nlrp2Q4PLS0 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nlrp2Q4PLS0 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nlrp2Q4PLS0 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nlrp2Q4PLS0 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Nlrp2Q4PLS0 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nlrp2Q4PLS0 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nlrp2Q4PLS0 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nlrp2Q4PLS0 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nlrp2Q4PLS0 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nlrp2Q4PLS0 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nlrp2Q4PLS0 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nlrp2Q4PLS0 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nlrp2Q4PLS0 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nlrp2Q4PLS0 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nlrp2Q4PLS0 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nlrp2Q4PLS0 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Nlrp2Q4PLS0 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nlrp2Q4PLS0 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nlrp2Q4PLS0 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nlrp2Q4PLS0 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nlrp2Q4PLS0 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nlrp2Q4PLS0 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nlrp2Q4PLS0 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nlrp2Q4PLS0 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nlrp2Q4PLS0 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nlrp2Q4PLS0 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Nlrp2Q4PLS0 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nlrp2Q4PLS0 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nlrp2Q4PLS0 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nlrp2Q4PLS0 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nlrp2Q4PLS0 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nlrp2Q4PLS0 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nlrp2Q4PLS0 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nlrp2Q4PLS0 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nlrp2Q4PLS0 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nlrp2Q4PLS0 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nlrp2Q4PLS0 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nlrp2Q4PLS0 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Nlrp2Q4PLS0 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nlrp2Q4PLS0 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nlrp2Q4PLS0 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nlrp2Q4PLS0 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nlrp2Q4PLS0 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nlrp2Q4PLS0 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nlrp2Q4PLS0 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nlrp2Q4PLS0 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nlrp2Q4PLS0 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Nlrp2Q4PLS0 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nlrp2Q4PLS0 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nlrp2Q4PLS0 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nlrp2Q4PLS0 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms