Protein–RNA interactions for Protein: Q4FZC9

Syne3, Nesprin-3, mousemouse

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Length 975 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne3Q4FZC9 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Syne3Q4FZC9 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Syne3Q4FZC9 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Syne3Q4FZC9 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Syne3Q4FZC9 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Syne3Q4FZC9 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Syne3Q4FZC9 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Syne3Q4FZC9 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Syne3Q4FZC9 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Syne3Q4FZC9 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Syne3Q4FZC9 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Syne3Q4FZC9 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Syne3Q4FZC9 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Syne3Q4FZC9 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Syne3Q4FZC9 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Syne3Q4FZC9 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Syne3Q4FZC9 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Syne3Q4FZC9 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Syne3Q4FZC9 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Syne3Q4FZC9 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Syne3Q4FZC9 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Syne3Q4FZC9 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Syne3Q4FZC9 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Syne3Q4FZC9 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Syne3Q4FZC9 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Syne3Q4FZC9 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Syne3Q4FZC9 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Syne3Q4FZC9 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Syne3Q4FZC9 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Syne3Q4FZC9 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Syne3Q4FZC9 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Syne3Q4FZC9 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Syne3Q4FZC9 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Syne3Q4FZC9 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Syne3Q4FZC9 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Syne3Q4FZC9 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Syne3Q4FZC9 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Syne3Q4FZC9 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Syne3Q4FZC9 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Syne3Q4FZC9 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Syne3Q4FZC9 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Syne3Q4FZC9 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Syne3Q4FZC9 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Syne3Q4FZC9 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Syne3Q4FZC9 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Syne3Q4FZC9 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Syne3Q4FZC9 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Syne3Q4FZC9 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Syne3Q4FZC9 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Syne3Q4FZC9 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Syne3Q4FZC9 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Syne3Q4FZC9 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Syne3Q4FZC9 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Syne3Q4FZC9 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Syne3Q4FZC9 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
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Syne3Q4FZC9 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
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Syne3Q4FZC9 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Syne3Q4FZC9 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Syne3Q4FZC9 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Syne3Q4FZC9 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
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Syne3Q4FZC9 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
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Syne3Q4FZC9 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Syne3Q4FZC9 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
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Syne3Q4FZC9 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Syne3Q4FZC9 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Syne3Q4FZC9 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Syne3Q4FZC9 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Syne3Q4FZC9 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Syne3Q4FZC9 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Syne3Q4FZC9 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Syne3Q4FZC9 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Syne3Q4FZC9 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Syne3Q4FZC9 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Syne3Q4FZC9 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Syne3Q4FZC9 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Syne3Q4FZC9 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Syne3Q4FZC9 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Syne3Q4FZC9 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Syne3Q4FZC9 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Syne3Q4FZC9 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Syne3Q4FZC9 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Syne3Q4FZC9 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Syne3Q4FZC9 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Syne3Q4FZC9 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Syne3Q4FZC9 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Syne3Q4FZC9 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Syne3Q4FZC9 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Syne3Q4FZC9 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
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