Protein–RNA interactions for Protein: Q4FK66

Prpf38a, Pre-mRNA-splicing factor 38A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf38aQ4FK66 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Prpf38aQ4FK66 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Prpf38aQ4FK66 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Prpf38aQ4FK66 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Prpf38aQ4FK66 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Prpf38aQ4FK66 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Prpf38aQ4FK66 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Prpf38aQ4FK66 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Prpf38aQ4FK66 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Prpf38aQ4FK66 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Prpf38aQ4FK66 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Prpf38aQ4FK66 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Prpf38aQ4FK66 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Prpf38aQ4FK66 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Prpf38aQ4FK66 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Prpf38aQ4FK66 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Prpf38aQ4FK66 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Prpf38aQ4FK66 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Prpf38aQ4FK66 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Prpf38aQ4FK66 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Prpf38aQ4FK66 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Prpf38aQ4FK66 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Prpf38aQ4FK66 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Prpf38aQ4FK66 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Prpf38aQ4FK66 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Prpf38aQ4FK66 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Prpf38aQ4FK66 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Prpf38aQ4FK66 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Prpf38aQ4FK66 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Prpf38aQ4FK66 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Prpf38aQ4FK66 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Prpf38aQ4FK66 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Prpf38aQ4FK66 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Prpf38aQ4FK66 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Prpf38aQ4FK66 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Prpf38aQ4FK66 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Prpf38aQ4FK66 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Prpf38aQ4FK66 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Prpf38aQ4FK66 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Prpf38aQ4FK66 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Prpf38aQ4FK66 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Prpf38aQ4FK66 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Prpf38aQ4FK66 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Prpf38aQ4FK66 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Prpf38aQ4FK66 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Prpf38aQ4FK66 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Prpf38aQ4FK66 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Prpf38aQ4FK66 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Prpf38aQ4FK66 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Prpf38aQ4FK66 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Prpf38aQ4FK66 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Prpf38aQ4FK66 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Prpf38aQ4FK66 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Prpf38aQ4FK66 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Prpf38aQ4FK66 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Prpf38aQ4FK66 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Prpf38aQ4FK66 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Prpf38aQ4FK66 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Prpf38aQ4FK66 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Prpf38aQ4FK66 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Prpf38aQ4FK66 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Prpf38aQ4FK66 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Prpf38aQ4FK66 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Prpf38aQ4FK66 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Prpf38aQ4FK66 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Prpf38aQ4FK66 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Prpf38aQ4FK66 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Prpf38aQ4FK66 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Prpf38aQ4FK66 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Prpf38aQ4FK66 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Prpf38aQ4FK66 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Prpf38aQ4FK66 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Prpf38aQ4FK66 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Prpf38aQ4FK66 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Prpf38aQ4FK66 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Prpf38aQ4FK66 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Prpf38aQ4FK66 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Prpf38aQ4FK66 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Prpf38aQ4FK66 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Prpf38aQ4FK66 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Prpf38aQ4FK66 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Prpf38aQ4FK66 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Prpf38aQ4FK66 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Prpf38aQ4FK66 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Prpf38aQ4FK66 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Prpf38aQ4FK66 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Prpf38aQ4FK66 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Prpf38aQ4FK66 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Prpf38aQ4FK66 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Prpf38aQ4FK66 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Prpf38aQ4FK66 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Prpf38aQ4FK66 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Prpf38aQ4FK66 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Prpf38aQ4FK66 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Prpf38aQ4FK66 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Prpf38aQ4FK66 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Prpf38aQ4FK66 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Prpf38aQ4FK66 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Prpf38aQ4FK66 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Prpf38aQ4FK66 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.2 ms