Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3Q7

Pacs2, Phosphofurin acidic cluster sorting protein 2, mousemouse

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Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacs2Q3V3Q7 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pacs2Q3V3Q7 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pacs2Q3V3Q7 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pacs2Q3V3Q7 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pacs2Q3V3Q7 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pacs2Q3V3Q7 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pacs2Q3V3Q7 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pacs2Q3V3Q7 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pacs2Q3V3Q7 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pacs2Q3V3Q7 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pacs2Q3V3Q7 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pacs2Q3V3Q7 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pacs2Q3V3Q7 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pacs2Q3V3Q7 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Pacs2Q3V3Q7 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pacs2Q3V3Q7 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pacs2Q3V3Q7 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pacs2Q3V3Q7 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pacs2Q3V3Q7 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pacs2Q3V3Q7 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pacs2Q3V3Q7 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pacs2Q3V3Q7 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pacs2Q3V3Q7 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pacs2Q3V3Q7 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pacs2Q3V3Q7 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pacs2Q3V3Q7 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pacs2Q3V3Q7 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pacs2Q3V3Q7 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pacs2Q3V3Q7 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Pacs2Q3V3Q7 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pacs2Q3V3Q7 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pacs2Q3V3Q7 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Pacs2Q3V3Q7 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Pacs2Q3V3Q7 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Pacs2Q3V3Q7 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Pacs2Q3V3Q7 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Pacs2Q3V3Q7 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Pacs2Q3V3Q7 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pacs2Q3V3Q7 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Pacs2Q3V3Q7 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pacs2Q3V3Q7 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pacs2Q3V3Q7 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pacs2Q3V3Q7 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pacs2Q3V3Q7 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pacs2Q3V3Q7 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pacs2Q3V3Q7 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pacs2Q3V3Q7 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pacs2Q3V3Q7 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pacs2Q3V3Q7 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pacs2Q3V3Q7 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pacs2Q3V3Q7 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pacs2Q3V3Q7 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pacs2Q3V3Q7 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pacs2Q3V3Q7 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pacs2Q3V3Q7 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pacs2Q3V3Q7 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pacs2Q3V3Q7 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pacs2Q3V3Q7 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pacs2Q3V3Q7 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Pacs2Q3V3Q7 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pacs2Q3V3Q7 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pacs2Q3V3Q7 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pacs2Q3V3Q7 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pacs2Q3V3Q7 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pacs2Q3V3Q7 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pacs2Q3V3Q7 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pacs2Q3V3Q7 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pacs2Q3V3Q7 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pacs2Q3V3Q7 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pacs2Q3V3Q7 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pacs2Q3V3Q7 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pacs2Q3V3Q7 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Pacs2Q3V3Q7 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pacs2Q3V3Q7 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Pacs2Q3V3Q7 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pacs2Q3V3Q7 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pacs2Q3V3Q7 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pacs2Q3V3Q7 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pacs2Q3V3Q7 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pacs2Q3V3Q7 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pacs2Q3V3Q7 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pacs2Q3V3Q7 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pacs2Q3V3Q7 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pacs2Q3V3Q7 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pacs2Q3V3Q7 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pacs2Q3V3Q7 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pacs2Q3V3Q7 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pacs2Q3V3Q7 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pacs2Q3V3Q7 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pacs2Q3V3Q7 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pacs2Q3V3Q7 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pacs2Q3V3Q7 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pacs2Q3V3Q7 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pacs2Q3V3Q7 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pacs2Q3V3Q7 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pacs2Q3V3Q7 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pacs2Q3V3Q7 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pacs2Q3V3Q7 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pacs2Q3V3Q7 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pacs2Q3V3Q7 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms