Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0K5

4930567H17Rik, RIKEN cDNA 4930567H17 gene, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930567H17RikQ3V0K5 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
4930567H17RikQ3V0K5 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
4930567H17RikQ3V0K5 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
4930567H17RikQ3V0K5 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
4930567H17RikQ3V0K5 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
4930567H17RikQ3V0K5 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
4930567H17RikQ3V0K5 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
4930567H17RikQ3V0K5 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
4930567H17RikQ3V0K5 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
4930567H17RikQ3V0K5 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
4930567H17RikQ3V0K5 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
4930567H17RikQ3V0K5 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
4930567H17RikQ3V0K5 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
4930567H17RikQ3V0K5 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
4930567H17RikQ3V0K5 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
4930567H17RikQ3V0K5 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
4930567H17RikQ3V0K5 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
4930567H17RikQ3V0K5 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
4930567H17RikQ3V0K5 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
4930567H17RikQ3V0K5 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
4930567H17RikQ3V0K5 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
4930567H17RikQ3V0K5 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
4930567H17RikQ3V0K5 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
4930567H17RikQ3V0K5 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
4930567H17RikQ3V0K5 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
4930567H17RikQ3V0K5 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
4930567H17RikQ3V0K5 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
4930567H17RikQ3V0K5 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
4930567H17RikQ3V0K5 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
4930567H17RikQ3V0K5 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
4930567H17RikQ3V0K5 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
4930567H17RikQ3V0K5 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
4930567H17RikQ3V0K5 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
4930567H17RikQ3V0K5 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
4930567H17RikQ3V0K5 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
4930567H17RikQ3V0K5 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
4930567H17RikQ3V0K5 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
4930567H17RikQ3V0K5 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
4930567H17RikQ3V0K5 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
4930567H17RikQ3V0K5 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
4930567H17RikQ3V0K5 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
4930567H17RikQ3V0K5 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
4930567H17RikQ3V0K5 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
4930567H17RikQ3V0K5 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
4930567H17RikQ3V0K5 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
4930567H17RikQ3V0K5 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
4930567H17RikQ3V0K5 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
4930567H17RikQ3V0K5 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
4930567H17RikQ3V0K5 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
4930567H17RikQ3V0K5 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
4930567H17RikQ3V0K5 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
4930567H17RikQ3V0K5 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
4930567H17RikQ3V0K5 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
4930567H17RikQ3V0K5 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
4930567H17RikQ3V0K5 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
4930567H17RikQ3V0K5 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
4930567H17RikQ3V0K5 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
4930567H17RikQ3V0K5 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
4930567H17RikQ3V0K5 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
4930567H17RikQ3V0K5 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
4930567H17RikQ3V0K5 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
4930567H17RikQ3V0K5 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
4930567H17RikQ3V0K5 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
4930567H17RikQ3V0K5 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
4930567H17RikQ3V0K5 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
4930567H17RikQ3V0K5 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
4930567H17RikQ3V0K5 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
4930567H17RikQ3V0K5 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
4930567H17RikQ3V0K5 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
4930567H17RikQ3V0K5 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
4930567H17RikQ3V0K5 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
4930567H17RikQ3V0K5 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC26■■□□□ 1.75
4930567H17RikQ3V0K5 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
4930567H17RikQ3V0K5 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
4930567H17RikQ3V0K5 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
4930567H17RikQ3V0K5 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
4930567H17RikQ3V0K5 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
4930567H17RikQ3V0K5 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
4930567H17RikQ3V0K5 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
4930567H17RikQ3V0K5 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
4930567H17RikQ3V0K5 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
4930567H17RikQ3V0K5 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
4930567H17RikQ3V0K5 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
4930567H17RikQ3V0K5 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
4930567H17RikQ3V0K5 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
4930567H17RikQ3V0K5 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
4930567H17RikQ3V0K5 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
4930567H17RikQ3V0K5 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
4930567H17RikQ3V0K5 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
4930567H17RikQ3V0K5 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
4930567H17RikQ3V0K5 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
4930567H17RikQ3V0K5 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
4930567H17RikQ3V0K5 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
4930567H17RikQ3V0K5 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
4930567H17RikQ3V0K5 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
4930567H17RikQ3V0K5 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
4930567H17RikQ3V0K5 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
4930567H17RikQ3V0K5 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
4930567H17RikQ3V0K5 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
4930567H17RikQ3V0K5 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 289.4 ms