Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0E1

Uncharacterized protein C9orf131 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3V0E1 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Q3V0E1 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Q3V0E1 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Q3V0E1 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Q3V0E1 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Q3V0E1 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Q3V0E1 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Q3V0E1 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Q3V0E1 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Q3V0E1 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Q3V0E1 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Q3V0E1 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Q3V0E1 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Q3V0E1 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Q3V0E1 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Q3V0E1 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Q3V0E1 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Q3V0E1 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Q3V0E1 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Q3V0E1 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Q3V0E1 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Q3V0E1 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Q3V0E1 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Q3V0E1 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Q3V0E1 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Q3V0E1 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Q3V0E1 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Q3V0E1 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Q3V0E1 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Q3V0E1 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Q3V0E1 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Q3V0E1 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Q3V0E1 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Q3V0E1 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Q3V0E1 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Q3V0E1 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Q3V0E1 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Q3V0E1 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Q3V0E1 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Q3V0E1 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Q3V0E1 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Q3V0E1 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Q3V0E1 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Q3V0E1 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Q3V0E1 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Q3V0E1 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Q3V0E1 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Q3V0E1 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Q3V0E1 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Q3V0E1 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Q3V0E1 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Q3V0E1 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Q3V0E1 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Q3V0E1 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Q3V0E1 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Q3V0E1 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Q3V0E1 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Q3V0E1 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Q3V0E1 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Q3V0E1 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Q3V0E1 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Q3V0E1 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Q3V0E1 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Q3V0E1 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Q3V0E1 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Q3V0E1 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Q3V0E1 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Q3V0E1 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Q3V0E1 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Q3V0E1 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Q3V0E1 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Q3V0E1 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Q3V0E1 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Q3V0E1 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Q3V0E1 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Q3V0E1 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Q3V0E1 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Q3V0E1 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Q3V0E1 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Q3V0E1 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Q3V0E1 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Q3V0E1 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Q3V0E1 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Q3V0E1 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Q3V0E1 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Q3V0E1 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Q3V0E1 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Q3V0E1 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Q3V0E1 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Q3V0E1 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Q3V0E1 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Q3V0E1 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Q3V0E1 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Q3V0E1 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Q3V0E1 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Q3V0E1 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Q3V0E1 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Q3V0E1 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Q3V0E1 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Q3V0E1 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms