Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Usp48Q3V0C5 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Usp48Q3V0C5 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Usp48Q3V0C5 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Usp48Q3V0C5 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Usp48Q3V0C5 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
Usp48Q3V0C5 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Usp48Q3V0C5 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Usp48Q3V0C5 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Usp48Q3V0C5 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Usp48Q3V0C5 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Usp48Q3V0C5 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Usp48Q3V0C5 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Usp48Q3V0C5 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Usp48Q3V0C5 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Usp48Q3V0C5 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Usp48Q3V0C5 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Usp48Q3V0C5 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Usp48Q3V0C5 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Usp48Q3V0C5 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Usp48Q3V0C5 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Usp48Q3V0C5 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Usp48Q3V0C5 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Usp48Q3V0C5 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Usp48Q3V0C5 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Usp48Q3V0C5 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Usp48Q3V0C5 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Usp48Q3V0C5 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Usp48Q3V0C5 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Usp48Q3V0C5 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Usp48Q3V0C5 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Usp48Q3V0C5 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Usp48Q3V0C5 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Usp48Q3V0C5 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Usp48Q3V0C5 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Usp48Q3V0C5 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Usp48Q3V0C5 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Usp48Q3V0C5 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Usp48Q3V0C5 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Usp48Q3V0C5 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Usp48Q3V0C5 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Usp48Q3V0C5 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Usp48Q3V0C5 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Usp48Q3V0C5 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Usp48Q3V0C5 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Usp48Q3V0C5 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Usp48Q3V0C5 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Usp48Q3V0C5 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Usp48Q3V0C5 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Usp48Q3V0C5 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Usp48Q3V0C5 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Usp48Q3V0C5 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Usp48Q3V0C5 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Usp48Q3V0C5 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Usp48Q3V0C5 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Usp48Q3V0C5 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Usp48Q3V0C5 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Usp48Q3V0C5 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Usp48Q3V0C5 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Usp48Q3V0C5 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Usp48Q3V0C5 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Usp48Q3V0C5 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Usp48Q3V0C5 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Usp48Q3V0C5 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Usp48Q3V0C5 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Usp48Q3V0C5 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Usp48Q3V0C5 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Usp48Q3V0C5 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Usp48Q3V0C5 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Usp48Q3V0C5 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Usp48Q3V0C5 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Usp48Q3V0C5 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Usp48Q3V0C5 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Usp48Q3V0C5 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Usp48Q3V0C5 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Usp48Q3V0C5 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Usp48Q3V0C5 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Usp48Q3V0C5 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Usp48Q3V0C5 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Usp48Q3V0C5 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Usp48Q3V0C5 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Usp48Q3V0C5 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Usp48Q3V0C5 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Usp48Q3V0C5 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Usp48Q3V0C5 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Usp48Q3V0C5 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Usp48Q3V0C5 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Usp48Q3V0C5 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Usp48Q3V0C5 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Usp48Q3V0C5 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Usp48Q3V0C5 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Usp48Q3V0C5 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Usp48Q3V0C5 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Usp48Q3V0C5 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Usp48Q3V0C5 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Usp48Q3V0C5 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Usp48Q3V0C5 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Usp48Q3V0C5 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Usp48Q3V0C5 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Usp48Q3V0C5 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms