Protein–RNA interactions for Protein: Q3UYV8

Dnaaf3, Dynein assembly factor 3, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnaaf3Q3UYV8 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Dnaaf3Q3UYV8 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Dnaaf3Q3UYV8 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Dnaaf3Q3UYV8 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Dnaaf3Q3UYV8 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Dnaaf3Q3UYV8 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Dnaaf3Q3UYV8 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Dnaaf3Q3UYV8 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Dnaaf3Q3UYV8 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Dnaaf3Q3UYV8 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Dnaaf3Q3UYV8 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Dnaaf3Q3UYV8 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Dnaaf3Q3UYV8 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Dnaaf3Q3UYV8 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Dnaaf3Q3UYV8 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Dnaaf3Q3UYV8 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Dnaaf3Q3UYV8 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Dnaaf3Q3UYV8 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Dnaaf3Q3UYV8 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Dnaaf3Q3UYV8 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Dnaaf3Q3UYV8 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Dnaaf3Q3UYV8 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Dnaaf3Q3UYV8 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Dnaaf3Q3UYV8 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Dnaaf3Q3UYV8 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Dnaaf3Q3UYV8 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Dnaaf3Q3UYV8 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Dnaaf3Q3UYV8 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Dnaaf3Q3UYV8 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Dnaaf3Q3UYV8 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Dnaaf3Q3UYV8 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Dnaaf3Q3UYV8 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Dnaaf3Q3UYV8 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Dnaaf3Q3UYV8 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Dnaaf3Q3UYV8 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Dnaaf3Q3UYV8 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Dnaaf3Q3UYV8 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Dnaaf3Q3UYV8 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Dnaaf3Q3UYV8 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Dnaaf3Q3UYV8 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Dnaaf3Q3UYV8 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Dnaaf3Q3UYV8 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Dnaaf3Q3UYV8 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Dnaaf3Q3UYV8 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Dnaaf3Q3UYV8 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Dnaaf3Q3UYV8 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Dnaaf3Q3UYV8 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Dnaaf3Q3UYV8 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Dnaaf3Q3UYV8 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Dnaaf3Q3UYV8 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Dnaaf3Q3UYV8 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Dnaaf3Q3UYV8 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Dnaaf3Q3UYV8 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Dnaaf3Q3UYV8 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Dnaaf3Q3UYV8 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Dnaaf3Q3UYV8 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Dnaaf3Q3UYV8 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Dnaaf3Q3UYV8 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Dnaaf3Q3UYV8 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Dnaaf3Q3UYV8 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Dnaaf3Q3UYV8 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Dnaaf3Q3UYV8 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Dnaaf3Q3UYV8 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Dnaaf3Q3UYV8 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Dnaaf3Q3UYV8 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Dnaaf3Q3UYV8 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Dnaaf3Q3UYV8 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Dnaaf3Q3UYV8 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Dnaaf3Q3UYV8 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Dnaaf3Q3UYV8 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Dnaaf3Q3UYV8 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Dnaaf3Q3UYV8 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Dnaaf3Q3UYV8 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Dnaaf3Q3UYV8 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Dnaaf3Q3UYV8 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Dnaaf3Q3UYV8 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Dnaaf3Q3UYV8 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Dnaaf3Q3UYV8 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Dnaaf3Q3UYV8 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Dnaaf3Q3UYV8 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Dnaaf3Q3UYV8 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Dnaaf3Q3UYV8 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Dnaaf3Q3UYV8 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Dnaaf3Q3UYV8 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Dnaaf3Q3UYV8 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Dnaaf3Q3UYV8 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Dnaaf3Q3UYV8 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Dnaaf3Q3UYV8 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Dnaaf3Q3UYV8 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Dnaaf3Q3UYV8 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Dnaaf3Q3UYV8 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Dnaaf3Q3UYV8 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Dnaaf3Q3UYV8 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Dnaaf3Q3UYV8 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Dnaaf3Q3UYV8 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Dnaaf3Q3UYV8 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Dnaaf3Q3UYV8 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Dnaaf3Q3UYV8 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Dnaaf3Q3UYV8 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Dnaaf3Q3UYV8 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms