Protein–RNA interactions for Protein: Q3UXZ9

Kdm5a, Lysine-specific demethylase 5A, mousemouse

Predictions only

Length 1,690 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5aQ3UXZ9 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Kdm5aQ3UXZ9 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Kdm5aQ3UXZ9 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Kdm5aQ3UXZ9 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Kdm5aQ3UXZ9 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
Kdm5aQ3UXZ9 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Kdm5aQ3UXZ9 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Kdm5aQ3UXZ9 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Kdm5aQ3UXZ9 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
Kdm5aQ3UXZ9 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Kdm5aQ3UXZ9 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Kdm5aQ3UXZ9 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Kdm5aQ3UXZ9 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Kdm5aQ3UXZ9 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Kdm5aQ3UXZ9 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Kdm5aQ3UXZ9 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Kdm5aQ3UXZ9 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Kdm5aQ3UXZ9 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Kdm5aQ3UXZ9 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Kdm5aQ3UXZ9 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Kdm5aQ3UXZ9 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Kdm5aQ3UXZ9 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Kdm5aQ3UXZ9 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
Kdm5aQ3UXZ9 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Kdm5aQ3UXZ9 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Kdm5aQ3UXZ9 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Kdm5aQ3UXZ9 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Kdm5aQ3UXZ9 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
Kdm5aQ3UXZ9 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Kdm5aQ3UXZ9 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Kdm5aQ3UXZ9 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Kdm5aQ3UXZ9 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Kdm5aQ3UXZ9 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
Kdm5aQ3UXZ9 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Kdm5aQ3UXZ9 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Kdm5aQ3UXZ9 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Kdm5aQ3UXZ9 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Kdm5aQ3UXZ9 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Kdm5aQ3UXZ9 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Kdm5aQ3UXZ9 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Kdm5aQ3UXZ9 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Kdm5aQ3UXZ9 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
Kdm5aQ3UXZ9 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
Kdm5aQ3UXZ9 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Kdm5aQ3UXZ9 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Kdm5aQ3UXZ9 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Kdm5aQ3UXZ9 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
Kdm5aQ3UXZ9 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Kdm5aQ3UXZ9 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Kdm5aQ3UXZ9 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Kdm5aQ3UXZ9 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Kdm5aQ3UXZ9 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Kdm5aQ3UXZ9 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
Kdm5aQ3UXZ9 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Kdm5aQ3UXZ9 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Kdm5aQ3UXZ9 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
Kdm5aQ3UXZ9 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Kdm5aQ3UXZ9 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Kdm5aQ3UXZ9 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Kdm5aQ3UXZ9 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Kdm5aQ3UXZ9 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Kdm5aQ3UXZ9 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Kdm5aQ3UXZ9 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Kdm5aQ3UXZ9 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
Kdm5aQ3UXZ9 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Kdm5aQ3UXZ9 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
Kdm5aQ3UXZ9 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
Kdm5aQ3UXZ9 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Kdm5aQ3UXZ9 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Kdm5aQ3UXZ9 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Kdm5aQ3UXZ9 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Kdm5aQ3UXZ9 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
Kdm5aQ3UXZ9 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Kdm5aQ3UXZ9 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Kdm5aQ3UXZ9 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Kdm5aQ3UXZ9 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
Kdm5aQ3UXZ9 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
Kdm5aQ3UXZ9 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
Kdm5aQ3UXZ9 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Kdm5aQ3UXZ9 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Kdm5aQ3UXZ9 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Kdm5aQ3UXZ9 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Kdm5aQ3UXZ9 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Kdm5aQ3UXZ9 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Kdm5aQ3UXZ9 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Kdm5aQ3UXZ9 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Kdm5aQ3UXZ9 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Kdm5aQ3UXZ9 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Kdm5aQ3UXZ9 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Kdm5aQ3UXZ9 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
Kdm5aQ3UXZ9 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Kdm5aQ3UXZ9 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Kdm5aQ3UXZ9 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Kdm5aQ3UXZ9 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Kdm5aQ3UXZ9 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Kdm5aQ3UXZ9 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Kdm5aQ3UXZ9 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Kdm5aQ3UXZ9 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Kdm5aQ3UXZ9 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Kdm5aQ3UXZ9 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
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