Protein–RNA interactions for Protein: Q3UX49

C87499, Expressed sequence C87499, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C87499Q3UX49 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
C87499Q3UX49 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
C87499Q3UX49 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
C87499Q3UX49 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
C87499Q3UX49 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
C87499Q3UX49 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
C87499Q3UX49 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
C87499Q3UX49 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
C87499Q3UX49 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
C87499Q3UX49 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
C87499Q3UX49 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
C87499Q3UX49 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
C87499Q3UX49 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
C87499Q3UX49 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
C87499Q3UX49 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
C87499Q3UX49 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
C87499Q3UX49 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C87499Q3UX49 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
C87499Q3UX49 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C87499Q3UX49 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C87499Q3UX49 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
C87499Q3UX49 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C87499Q3UX49 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C87499Q3UX49 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C87499Q3UX49 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C87499Q3UX49 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
C87499Q3UX49 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
C87499Q3UX49 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
C87499Q3UX49 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
C87499Q3UX49 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
C87499Q3UX49 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
C87499Q3UX49 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
C87499Q3UX49 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
C87499Q3UX49 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
C87499Q3UX49 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
C87499Q3UX49 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
C87499Q3UX49 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
C87499Q3UX49 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
C87499Q3UX49 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
C87499Q3UX49 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
C87499Q3UX49 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
C87499Q3UX49 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
C87499Q3UX49 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
C87499Q3UX49 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
C87499Q3UX49 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
C87499Q3UX49 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
C87499Q3UX49 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
C87499Q3UX49 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
C87499Q3UX49 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
C87499Q3UX49 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
C87499Q3UX49 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
C87499Q3UX49 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
C87499Q3UX49 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
C87499Q3UX49 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
C87499Q3UX49 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
C87499Q3UX49 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
C87499Q3UX49 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
C87499Q3UX49 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
C87499Q3UX49 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
C87499Q3UX49 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
C87499Q3UX49 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
C87499Q3UX49 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
C87499Q3UX49 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
C87499Q3UX49 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
C87499Q3UX49 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
C87499Q3UX49 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
C87499Q3UX49 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
C87499Q3UX49 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
C87499Q3UX49 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
C87499Q3UX49 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
C87499Q3UX49 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
C87499Q3UX49 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
C87499Q3UX49 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
C87499Q3UX49 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
C87499Q3UX49 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
C87499Q3UX49 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
C87499Q3UX49 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
C87499Q3UX49 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
C87499Q3UX49 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
C87499Q3UX49 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
C87499Q3UX49 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C87499Q3UX49 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
C87499Q3UX49 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C87499Q3UX49 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C87499Q3UX49 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C87499Q3UX49 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C87499Q3UX49 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
C87499Q3UX49 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C87499Q3UX49 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C87499Q3UX49 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C87499Q3UX49 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
C87499Q3UX49 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
C87499Q3UX49 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
C87499Q3UX49 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
C87499Q3UX49 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
C87499Q3UX49 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
C87499Q3UX49 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
C87499Q3UX49 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
C87499Q3UX49 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
C87499Q3UX49 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.3 ms