Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPL0

Sec31a, Protein transport protein Sec31A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec31aQ3UPL0 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sec31aQ3UPL0 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sec31aQ3UPL0 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sec31aQ3UPL0 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sec31aQ3UPL0 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sec31aQ3UPL0 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sec31aQ3UPL0 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sec31aQ3UPL0 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sec31aQ3UPL0 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sec31aQ3UPL0 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sec31aQ3UPL0 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Sec31aQ3UPL0 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sec31aQ3UPL0 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sec31aQ3UPL0 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sec31aQ3UPL0 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sec31aQ3UPL0 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sec31aQ3UPL0 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sec31aQ3UPL0 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sec31aQ3UPL0 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sec31aQ3UPL0 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sec31aQ3UPL0 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sec31aQ3UPL0 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sec31aQ3UPL0 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sec31aQ3UPL0 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sec31aQ3UPL0 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sec31aQ3UPL0 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sec31aQ3UPL0 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sec31aQ3UPL0 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sec31aQ3UPL0 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sec31aQ3UPL0 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sec31aQ3UPL0 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sec31aQ3UPL0 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sec31aQ3UPL0 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sec31aQ3UPL0 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sec31aQ3UPL0 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sec31aQ3UPL0 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sec31aQ3UPL0 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sec31aQ3UPL0 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sec31aQ3UPL0 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sec31aQ3UPL0 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sec31aQ3UPL0 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sec31aQ3UPL0 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sec31aQ3UPL0 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sec31aQ3UPL0 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sec31aQ3UPL0 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sec31aQ3UPL0 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sec31aQ3UPL0 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sec31aQ3UPL0 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sec31aQ3UPL0 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sec31aQ3UPL0 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Sec31aQ3UPL0 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sec31aQ3UPL0 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sec31aQ3UPL0 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sec31aQ3UPL0 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sec31aQ3UPL0 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sec31aQ3UPL0 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sec31aQ3UPL0 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Sec31aQ3UPL0 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sec31aQ3UPL0 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sec31aQ3UPL0 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Sec31aQ3UPL0 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sec31aQ3UPL0 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sec31aQ3UPL0 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Sec31aQ3UPL0 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Sec31aQ3UPL0 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sec31aQ3UPL0 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sec31aQ3UPL0 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sec31aQ3UPL0 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sec31aQ3UPL0 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sec31aQ3UPL0 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sec31aQ3UPL0 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sec31aQ3UPL0 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sec31aQ3UPL0 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sec31aQ3UPL0 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sec31aQ3UPL0 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sec31aQ3UPL0 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sec31aQ3UPL0 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sec31aQ3UPL0 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sec31aQ3UPL0 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sec31aQ3UPL0 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sec31aQ3UPL0 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sec31aQ3UPL0 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sec31aQ3UPL0 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sec31aQ3UPL0 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sec31aQ3UPL0 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sec31aQ3UPL0 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sec31aQ3UPL0 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sec31aQ3UPL0 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sec31aQ3UPL0 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sec31aQ3UPL0 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sec31aQ3UPL0 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sec31aQ3UPL0 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sec31aQ3UPL0 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sec31aQ3UPL0 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sec31aQ3UPL0 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sec31aQ3UPL0 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sec31aQ3UPL0 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Sec31aQ3UPL0 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sec31aQ3UPL0 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sec31aQ3UPL0 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms