Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULW6

Ccdc33, Coiled-coil domain-containing protein 33, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc33Q3ULW6 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc33Q3ULW6 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc33Q3ULW6 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc33Q3ULW6 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc33Q3ULW6 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc33Q3ULW6 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc33Q3ULW6 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc33Q3ULW6 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc33Q3ULW6 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc33Q3ULW6 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc33Q3ULW6 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc33Q3ULW6 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc33Q3ULW6 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc33Q3ULW6 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc33Q3ULW6 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc33Q3ULW6 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc33Q3ULW6 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc33Q3ULW6 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc33Q3ULW6 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc33Q3ULW6 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc33Q3ULW6 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc33Q3ULW6 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc33Q3ULW6 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc33Q3ULW6 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc33Q3ULW6 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc33Q3ULW6 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc33Q3ULW6 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc33Q3ULW6 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc33Q3ULW6 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc33Q3ULW6 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc33Q3ULW6 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc33Q3ULW6 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc33Q3ULW6 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc33Q3ULW6 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc33Q3ULW6 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc33Q3ULW6 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc33Q3ULW6 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc33Q3ULW6 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc33Q3ULW6 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc33Q3ULW6 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc33Q3ULW6 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc33Q3ULW6 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc33Q3ULW6 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc33Q3ULW6 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc33Q3ULW6 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc33Q3ULW6 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc33Q3ULW6 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc33Q3ULW6 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc33Q3ULW6 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc33Q3ULW6 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc33Q3ULW6 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc33Q3ULW6 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc33Q3ULW6 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc33Q3ULW6 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc33Q3ULW6 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc33Q3ULW6 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc33Q3ULW6 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc33Q3ULW6 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc33Q3ULW6 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc33Q3ULW6 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc33Q3ULW6 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc33Q3ULW6 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc33Q3ULW6 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc33Q3ULW6 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc33Q3ULW6 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc33Q3ULW6 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc33Q3ULW6 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc33Q3ULW6 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc33Q3ULW6 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc33Q3ULW6 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc33Q3ULW6 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc33Q3ULW6 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc33Q3ULW6 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc33Q3ULW6 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ccdc33Q3ULW6 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ccdc33Q3ULW6 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ccdc33Q3ULW6 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ccdc33Q3ULW6 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc33Q3ULW6 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc33Q3ULW6 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc33Q3ULW6 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc33Q3ULW6 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc33Q3ULW6 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc33Q3ULW6 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc33Q3ULW6 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc33Q3ULW6 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc33Q3ULW6 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc33Q3ULW6 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc33Q3ULW6 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc33Q3ULW6 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc33Q3ULW6 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc33Q3ULW6 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc33Q3ULW6 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc33Q3ULW6 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc33Q3ULW6 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc33Q3ULW6 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc33Q3ULW6 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc33Q3ULW6 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc33Q3ULW6 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc33Q3ULW6 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms