Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHX8

Nkx6-3, Homeobox protein Nkx-6.3, mousemouse

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Length 262 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx6-3Q3UHX8 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Nkx6-3Q3UHX8 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Nkx6-3Q3UHX8 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Nkx6-3Q3UHX8 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Nkx6-3Q3UHX8 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Nkx6-3Q3UHX8 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Nkx6-3Q3UHX8 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Nkx6-3Q3UHX8 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Nkx6-3Q3UHX8 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Nkx6-3Q3UHX8 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Nkx6-3Q3UHX8 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Nkx6-3Q3UHX8 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Nkx6-3Q3UHX8 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Nkx6-3Q3UHX8 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Nkx6-3Q3UHX8 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Nkx6-3Q3UHX8 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Nkx6-3Q3UHX8 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Nkx6-3Q3UHX8 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Nkx6-3Q3UHX8 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Nkx6-3Q3UHX8 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Nkx6-3Q3UHX8 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Nkx6-3Q3UHX8 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Nkx6-3Q3UHX8 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Nkx6-3Q3UHX8 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Nkx6-3Q3UHX8 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Nkx6-3Q3UHX8 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Nkx6-3Q3UHX8 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Nkx6-3Q3UHX8 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Nkx6-3Q3UHX8 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Nkx6-3Q3UHX8 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Nkx6-3Q3UHX8 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Nkx6-3Q3UHX8 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Nkx6-3Q3UHX8 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Nkx6-3Q3UHX8 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Nkx6-3Q3UHX8 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Nkx6-3Q3UHX8 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Nkx6-3Q3UHX8 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Nkx6-3Q3UHX8 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Nkx6-3Q3UHX8 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Nkx6-3Q3UHX8 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Nkx6-3Q3UHX8 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Nkx6-3Q3UHX8 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Nkx6-3Q3UHX8 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Nkx6-3Q3UHX8 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Nkx6-3Q3UHX8 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Nkx6-3Q3UHX8 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Nkx6-3Q3UHX8 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Nkx6-3Q3UHX8 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Nkx6-3Q3UHX8 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Nkx6-3Q3UHX8 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Nkx6-3Q3UHX8 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Nkx6-3Q3UHX8 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Nkx6-3Q3UHX8 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Nkx6-3Q3UHX8 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Nkx6-3Q3UHX8 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Nkx6-3Q3UHX8 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Nkx6-3Q3UHX8 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Nkx6-3Q3UHX8 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Nkx6-3Q3UHX8 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Nkx6-3Q3UHX8 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Nkx6-3Q3UHX8 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Nkx6-3Q3UHX8 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Nkx6-3Q3UHX8 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Nkx6-3Q3UHX8 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Nkx6-3Q3UHX8 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
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Nkx6-3Q3UHX8 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Nkx6-3Q3UHX8 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
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Nkx6-3Q3UHX8 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Nkx6-3Q3UHX8 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Nkx6-3Q3UHX8 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Nkx6-3Q3UHX8 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Nkx6-3Q3UHX8 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Nkx6-3Q3UHX8 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Nkx6-3Q3UHX8 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Nkx6-3Q3UHX8 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Nkx6-3Q3UHX8 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Nkx6-3Q3UHX8 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Nkx6-3Q3UHX8 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Nkx6-3Q3UHX8 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Nkx6-3Q3UHX8 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Nkx6-3Q3UHX8 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Nkx6-3Q3UHX8 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Nkx6-3Q3UHX8 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Nkx6-3Q3UHX8 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Nkx6-3Q3UHX8 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Nkx6-3Q3UHX8 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Nkx6-3Q3UHX8 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Nkx6-3Q3UHX8 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Nkx6-3Q3UHX8 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nkx6-3Q3UHX8 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nkx6-3Q3UHX8 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nkx6-3Q3UHX8 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nkx6-3Q3UHX8 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Nkx6-3Q3UHX8 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nkx6-3Q3UHX8 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nkx6-3Q3UHX8 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Nkx6-3Q3UHX8 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Nkx6-3Q3UHX8 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 572.1 ms