Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGK8

Gm5113, Predicted gene 5113, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5113Q3UGK8 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm5113Q3UGK8 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm5113Q3UGK8 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm5113Q3UGK8 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm5113Q3UGK8 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm5113Q3UGK8 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm5113Q3UGK8 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gm5113Q3UGK8 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gm5113Q3UGK8 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm5113Q3UGK8 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm5113Q3UGK8 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm5113Q3UGK8 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm5113Q3UGK8 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm5113Q3UGK8 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm5113Q3UGK8 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm5113Q3UGK8 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm5113Q3UGK8 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm5113Q3UGK8 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm5113Q3UGK8 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm5113Q3UGK8 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm5113Q3UGK8 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm5113Q3UGK8 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm5113Q3UGK8 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm5113Q3UGK8 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm5113Q3UGK8 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm5113Q3UGK8 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm5113Q3UGK8 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm5113Q3UGK8 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm5113Q3UGK8 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm5113Q3UGK8 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm5113Q3UGK8 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm5113Q3UGK8 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm5113Q3UGK8 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm5113Q3UGK8 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm5113Q3UGK8 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm5113Q3UGK8 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm5113Q3UGK8 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm5113Q3UGK8 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm5113Q3UGK8 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm5113Q3UGK8 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm5113Q3UGK8 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm5113Q3UGK8 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm5113Q3UGK8 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm5113Q3UGK8 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm5113Q3UGK8 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm5113Q3UGK8 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm5113Q3UGK8 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm5113Q3UGK8 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm5113Q3UGK8 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm5113Q3UGK8 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm5113Q3UGK8 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm5113Q3UGK8 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm5113Q3UGK8 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm5113Q3UGK8 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm5113Q3UGK8 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm5113Q3UGK8 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm5113Q3UGK8 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm5113Q3UGK8 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm5113Q3UGK8 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm5113Q3UGK8 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm5113Q3UGK8 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm5113Q3UGK8 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm5113Q3UGK8 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm5113Q3UGK8 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm5113Q3UGK8 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm5113Q3UGK8 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm5113Q3UGK8 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm5113Q3UGK8 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm5113Q3UGK8 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm5113Q3UGK8 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm5113Q3UGK8 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm5113Q3UGK8 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm5113Q3UGK8 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm5113Q3UGK8 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm5113Q3UGK8 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm5113Q3UGK8 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm5113Q3UGK8 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm5113Q3UGK8 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm5113Q3UGK8 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm5113Q3UGK8 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm5113Q3UGK8 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm5113Q3UGK8 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm5113Q3UGK8 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm5113Q3UGK8 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm5113Q3UGK8 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm5113Q3UGK8 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm5113Q3UGK8 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm5113Q3UGK8 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm5113Q3UGK8 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm5113Q3UGK8 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm5113Q3UGK8 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm5113Q3UGK8 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm5113Q3UGK8 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm5113Q3UGK8 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm5113Q3UGK8 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm5113Q3UGK8 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm5113Q3UGK8 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm5113Q3UGK8 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm5113Q3UGK8 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm5113Q3UGK8 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms